Protein–RNA interactions for Protein: P0DJI9

SAA2, Serum amyloid A-2 protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 122 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAA2P0DJI9 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SAA2P0DJI9 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SAA2P0DJI9 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SAA2P0DJI9 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SAA2P0DJI9 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SAA2P0DJI9 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SAA2P0DJI9 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SAA2P0DJI9 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SAA2P0DJI9 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SAA2P0DJI9 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SAA2P0DJI9 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SAA2P0DJI9 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SAA2P0DJI9 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SAA2P0DJI9 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SAA2P0DJI9 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SAA2P0DJI9 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SAA2P0DJI9 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SAA2P0DJI9 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SAA2P0DJI9 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SAA2P0DJI9 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SAA2P0DJI9 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SAA2P0DJI9 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SAA2P0DJI9 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SAA2P0DJI9 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SAA2P0DJI9 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SAA2P0DJI9 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SAA2P0DJI9 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SAA2P0DJI9 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SAA2P0DJI9 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
SAA2P0DJI9 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SAA2P0DJI9 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SAA2P0DJI9 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SAA2P0DJI9 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SAA2P0DJI9 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SAA2P0DJI9 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SAA2P0DJI9 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SAA2P0DJI9 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SAA2P0DJI9 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SAA2P0DJI9 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SAA2P0DJI9 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SAA2P0DJI9 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SAA2P0DJI9 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SAA2P0DJI9 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SAA2P0DJI9 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SAA2P0DJI9 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SAA2P0DJI9 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SAA2P0DJI9 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SAA2P0DJI9 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SAA2P0DJI9 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SAA2P0DJI9 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SAA2P0DJI9 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SAA2P0DJI9 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SAA2P0DJI9 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SAA2P0DJI9 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SAA2P0DJI9 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SAA2P0DJI9 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SAA2P0DJI9 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SAA2P0DJI9 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SAA2P0DJI9 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SAA2P0DJI9 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SAA2P0DJI9 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SAA2P0DJI9 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SAA2P0DJI9 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SAA2P0DJI9 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SAA2P0DJI9 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SAA2P0DJI9 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SAA2P0DJI9 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SAA2P0DJI9 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SAA2P0DJI9 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SAA2P0DJI9 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SAA2P0DJI9 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SAA2P0DJI9 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SAA2P0DJI9 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SAA2P0DJI9 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SAA2P0DJI9 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SAA2P0DJI9 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SAA2P0DJI9 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SAA2P0DJI9 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SAA2P0DJI9 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SAA2P0DJI9 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SAA2P0DJI9 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
SAA2P0DJI9 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SAA2P0DJI9 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SAA2P0DJI9 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SAA2P0DJI9 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SAA2P0DJI9 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SAA2P0DJI9 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SAA2P0DJI9 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SAA2P0DJI9 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
SAA2P0DJI9 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
SAA2P0DJI9 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SAA2P0DJI9 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SAA2P0DJI9 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SAA2P0DJI9 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SAA2P0DJI9 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SAA2P0DJI9 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SAA2P0DJI9 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SAA2P0DJI9 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SAA2P0DJI9 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SAA2P0DJI9 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.5 ms