Protein–RNA interactions for Protein: P0CF51

TRGC1, T-cell receptor gamma chain C region 1, humanhuman

Predictions only

Length 173 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRGC1P0CF51 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRGC1P0CF51 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRGC1P0CF51 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRGC1P0CF51 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRGC1P0CF51 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRGC1P0CF51 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRGC1P0CF51 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRGC1P0CF51 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRGC1P0CF51 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRGC1P0CF51 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRGC1P0CF51 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRGC1P0CF51 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRGC1P0CF51 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRGC1P0CF51 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRGC1P0CF51 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
TRGC1P0CF51 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRGC1P0CF51 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
TRGC1P0CF51 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRGC1P0CF51 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRGC1P0CF51 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRGC1P0CF51 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRGC1P0CF51 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRGC1P0CF51 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRGC1P0CF51 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRGC1P0CF51 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRGC1P0CF51 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRGC1P0CF51 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRGC1P0CF51 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRGC1P0CF51 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRGC1P0CF51 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRGC1P0CF51 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRGC1P0CF51 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRGC1P0CF51 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRGC1P0CF51 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRGC1P0CF51 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRGC1P0CF51 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRGC1P0CF51 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRGC1P0CF51 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
TRGC1P0CF51 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRGC1P0CF51 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRGC1P0CF51 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRGC1P0CF51 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRGC1P0CF51 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRGC1P0CF51 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRGC1P0CF51 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRGC1P0CF51 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRGC1P0CF51 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRGC1P0CF51 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRGC1P0CF51 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRGC1P0CF51 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRGC1P0CF51 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRGC1P0CF51 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRGC1P0CF51 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRGC1P0CF51 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRGC1P0CF51 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRGC1P0CF51 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRGC1P0CF51 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRGC1P0CF51 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRGC1P0CF51 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRGC1P0CF51 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRGC1P0CF51 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRGC1P0CF51 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRGC1P0CF51 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRGC1P0CF51 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRGC1P0CF51 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRGC1P0CF51 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRGC1P0CF51 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRGC1P0CF51 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRGC1P0CF51 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRGC1P0CF51 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRGC1P0CF51 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRGC1P0CF51 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRGC1P0CF51 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRGC1P0CF51 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRGC1P0CF51 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRGC1P0CF51 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRGC1P0CF51 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRGC1P0CF51 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRGC1P0CF51 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRGC1P0CF51 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
TRGC1P0CF51 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
TRGC1P0CF51 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRGC1P0CF51 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRGC1P0CF51 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRGC1P0CF51 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
TRGC1P0CF51 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRGC1P0CF51 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRGC1P0CF51 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRGC1P0CF51 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRGC1P0CF51 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRGC1P0CF51 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TRGC1P0CF51 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TRGC1P0CF51 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TRGC1P0CF51 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TRGC1P0CF51 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TRGC1P0CF51 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TRGC1P0CF51 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
TRGC1P0CF51 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TRGC1P0CF51 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TRGC1P0CF51 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.4 ms