Protein–RNA interactions for Protein: P0C7V7

SEC11B, Putative signal peptidase complex catalytic subunit SEC11B, humanhuman

Predictions only

Length 166 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC11BP0C7V7 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SEC11BP0C7V7 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SEC11BP0C7V7 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SEC11BP0C7V7 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SEC11BP0C7V7 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SEC11BP0C7V7 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SEC11BP0C7V7 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SEC11BP0C7V7 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SEC11BP0C7V7 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
SEC11BP0C7V7 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SEC11BP0C7V7 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SEC11BP0C7V7 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
SEC11BP0C7V7 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SEC11BP0C7V7 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
SEC11BP0C7V7 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SEC11BP0C7V7 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SEC11BP0C7V7 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SEC11BP0C7V7 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
SEC11BP0C7V7 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
SEC11BP0C7V7 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SEC11BP0C7V7 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
SEC11BP0C7V7 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SEC11BP0C7V7 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SEC11BP0C7V7 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SEC11BP0C7V7 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SEC11BP0C7V7 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SEC11BP0C7V7 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
SEC11BP0C7V7 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SEC11BP0C7V7 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SEC11BP0C7V7 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SEC11BP0C7V7 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SEC11BP0C7V7 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SEC11BP0C7V7 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SEC11BP0C7V7 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SEC11BP0C7V7 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SEC11BP0C7V7 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SEC11BP0C7V7 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SEC11BP0C7V7 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SEC11BP0C7V7 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SEC11BP0C7V7 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SEC11BP0C7V7 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SEC11BP0C7V7 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SEC11BP0C7V7 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SEC11BP0C7V7 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SEC11BP0C7V7 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SEC11BP0C7V7 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SEC11BP0C7V7 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SEC11BP0C7V7 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SEC11BP0C7V7 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
SEC11BP0C7V7 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SEC11BP0C7V7 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SEC11BP0C7V7 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SEC11BP0C7V7 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SEC11BP0C7V7 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SEC11BP0C7V7 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SEC11BP0C7V7 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SEC11BP0C7V7 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SEC11BP0C7V7 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SEC11BP0C7V7 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SEC11BP0C7V7 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SEC11BP0C7V7 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SEC11BP0C7V7 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SEC11BP0C7V7 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SEC11BP0C7V7 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SEC11BP0C7V7 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SEC11BP0C7V7 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SEC11BP0C7V7 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
SEC11BP0C7V7 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SEC11BP0C7V7 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SEC11BP0C7V7 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SEC11BP0C7V7 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SEC11BP0C7V7 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SEC11BP0C7V7 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SEC11BP0C7V7 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SEC11BP0C7V7 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SEC11BP0C7V7 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SEC11BP0C7V7 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SEC11BP0C7V7 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SEC11BP0C7V7 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SEC11BP0C7V7 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SEC11BP0C7V7 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SEC11BP0C7V7 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SEC11BP0C7V7 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SEC11BP0C7V7 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SEC11BP0C7V7 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SEC11BP0C7V7 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SEC11BP0C7V7 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SEC11BP0C7V7 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SEC11BP0C7V7 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SEC11BP0C7V7 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SEC11BP0C7V7 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SEC11BP0C7V7 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SEC11BP0C7V7 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
SEC11BP0C7V7 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SEC11BP0C7V7 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SEC11BP0C7V7 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SEC11BP0C7V7 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
SEC11BP0C7V7 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SEC11BP0C7V7 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SEC11BP0C7V7 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.7 ms