Protein–RNA interactions for Protein: P0C221

CCDC175, Coiled-coil domain-containing protein 175, humanhuman

Predictions only

Length 793 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC175P0C221 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CCDC175P0C221 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CCDC175P0C221 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
CCDC175P0C221 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CCDC175P0C221 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CCDC175P0C221 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CCDC175P0C221 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CCDC175P0C221 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CCDC175P0C221 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CCDC175P0C221 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CCDC175P0C221 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CCDC175P0C221 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
CCDC175P0C221 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CCDC175P0C221 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CCDC175P0C221 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CCDC175P0C221 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CCDC175P0C221 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CCDC175P0C221 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CCDC175P0C221 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CCDC175P0C221 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CCDC175P0C221 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CCDC175P0C221 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CCDC175P0C221 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CCDC175P0C221 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CCDC175P0C221 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CCDC175P0C221 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CCDC175P0C221 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CCDC175P0C221 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CCDC175P0C221 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CCDC175P0C221 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CCDC175P0C221 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CCDC175P0C221 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CCDC175P0C221 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CCDC175P0C221 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CCDC175P0C221 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CCDC175P0C221 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CCDC175P0C221 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CCDC175P0C221 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CCDC175P0C221 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CCDC175P0C221 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CCDC175P0C221 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
CCDC175P0C221 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CCDC175P0C221 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CCDC175P0C221 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CCDC175P0C221 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CCDC175P0C221 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CCDC175P0C221 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
CCDC175P0C221 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CCDC175P0C221 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CCDC175P0C221 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CCDC175P0C221 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CCDC175P0C221 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CCDC175P0C221 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CCDC175P0C221 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CCDC175P0C221 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CCDC175P0C221 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CCDC175P0C221 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CCDC175P0C221 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CCDC175P0C221 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CCDC175P0C221 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CCDC175P0C221 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CCDC175P0C221 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
CCDC175P0C221 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CCDC175P0C221 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CCDC175P0C221 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CCDC175P0C221 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CCDC175P0C221 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CCDC175P0C221 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CCDC175P0C221 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
CCDC175P0C221 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CCDC175P0C221 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CCDC175P0C221 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CCDC175P0C221 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CCDC175P0C221 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CCDC175P0C221 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CCDC175P0C221 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CCDC175P0C221 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CCDC175P0C221 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CCDC175P0C221 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CCDC175P0C221 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CCDC175P0C221 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CCDC175P0C221 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CCDC175P0C221 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CCDC175P0C221 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CCDC175P0C221 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
CCDC175P0C221 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CCDC175P0C221 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CCDC175P0C221 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CCDC175P0C221 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CCDC175P0C221 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
CCDC175P0C221 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CCDC175P0C221 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CCDC175P0C221 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CCDC175P0C221 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CCDC175P0C221 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
CCDC175P0C221 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
CCDC175P0C221 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
CCDC175P0C221 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CCDC175P0C221 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CCDC175P0C221 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.8 ms