Protein–RNA interactions for Protein: P09067

HOXB5, Homeobox protein Hox-B5, humanhuman

Predictions only

Length 269 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB5P09067 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
HOXB5P09067 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
HOXB5P09067 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
HOXB5P09067 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
HOXB5P09067 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
HOXB5P09067 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
HOXB5P09067 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
HOXB5P09067 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
HOXB5P09067 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
HOXB5P09067 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
HOXB5P09067 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
HOXB5P09067 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
HOXB5P09067 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
HOXB5P09067 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
HOXB5P09067 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.26
HOXB5P09067 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
HOXB5P09067 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
HOXB5P09067 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
HOXB5P09067 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
HOXB5P09067 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
HOXB5P09067 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
HOXB5P09067 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
HOXB5P09067 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
HOXB5P09067 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
HOXB5P09067 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
HOXB5P09067 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
HOXB5P09067 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
HOXB5P09067 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
HOXB5P09067 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
HOXB5P09067 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
HOXB5P09067 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
HOXB5P09067 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
HOXB5P09067 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
HOXB5P09067 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
HOXB5P09067 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
HOXB5P09067 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
HOXB5P09067 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
HOXB5P09067 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
HOXB5P09067 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
HOXB5P09067 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
HOXB5P09067 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
HOXB5P09067 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
HOXB5P09067 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
HOXB5P09067 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
HOXB5P09067 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
HOXB5P09067 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
HOXB5P09067 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
HOXB5P09067 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
HOXB5P09067 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
HOXB5P09067 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
HOXB5P09067 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
HOXB5P09067 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
HOXB5P09067 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
HOXB5P09067 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
HOXB5P09067 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
HOXB5P09067 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
HOXB5P09067 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
HOXB5P09067 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC16.69■□□□□ 0.26
HOXB5P09067 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
HOXB5P09067 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
HOXB5P09067 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
HOXB5P09067 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
HOXB5P09067 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
HOXB5P09067 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
HOXB5P09067 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
HOXB5P09067 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
HOXB5P09067 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
HOXB5P09067 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
HOXB5P09067 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
HOXB5P09067 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
HOXB5P09067 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
HOXB5P09067 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
HOXB5P09067 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
HOXB5P09067 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
HOXB5P09067 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
HOXB5P09067 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
HOXB5P09067 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
HOXB5P09067 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
HOXB5P09067 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
HOXB5P09067 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
HOXB5P09067 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
HOXB5P09067 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
HOXB5P09067 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
HOXB5P09067 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
HOXB5P09067 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
HOXB5P09067 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
HOXB5P09067 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
HOXB5P09067 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
HOXB5P09067 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
HOXB5P09067 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
HOXB5P09067 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
HOXB5P09067 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
HOXB5P09067 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
HOXB5P09067 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
HOXB5P09067 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
HOXB5P09067 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
HOXB5P09067 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
HOXB5P09067 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
HOXB5P09067 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
HOXB5P09067 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.8 ms