Protein–RNA interactions for Protein: P05014

IFNA4, Interferon alpha-4, humanhuman

Predictions only

Length 189 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFNA4P05014 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
IFNA4P05014 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
IFNA4P05014 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
IFNA4P05014 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
IFNA4P05014 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
IFNA4P05014 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
IFNA4P05014 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
IFNA4P05014 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
IFNA4P05014 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
IFNA4P05014 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
IFNA4P05014 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
IFNA4P05014 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
IFNA4P05014 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
IFNA4P05014 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
IFNA4P05014 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
IFNA4P05014 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
IFNA4P05014 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
IFNA4P05014 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
IFNA4P05014 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
IFNA4P05014 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
IFNA4P05014 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
IFNA4P05014 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
IFNA4P05014 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC16.53■□□□□ 0.24
IFNA4P05014 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
IFNA4P05014 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
IFNA4P05014 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
IFNA4P05014 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
IFNA4P05014 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
IFNA4P05014 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
IFNA4P05014 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
IFNA4P05014 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
IFNA4P05014 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
IFNA4P05014 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
IFNA4P05014 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
IFNA4P05014 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
IFNA4P05014 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
IFNA4P05014 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
IFNA4P05014 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
IFNA4P05014 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
IFNA4P05014 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
IFNA4P05014 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
IFNA4P05014 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
IFNA4P05014 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
IFNA4P05014 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
IFNA4P05014 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
IFNA4P05014 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
IFNA4P05014 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
IFNA4P05014 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
IFNA4P05014 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
IFNA4P05014 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
IFNA4P05014 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
IFNA4P05014 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
IFNA4P05014 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
IFNA4P05014 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
IFNA4P05014 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
IFNA4P05014 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
IFNA4P05014 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
IFNA4P05014 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
IFNA4P05014 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
IFNA4P05014 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
IFNA4P05014 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
IFNA4P05014 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
IFNA4P05014 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
IFNA4P05014 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
IFNA4P05014 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
IFNA4P05014 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
IFNA4P05014 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
IFNA4P05014 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
IFNA4P05014 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
IFNA4P05014 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
IFNA4P05014 KIF13B-206ENST00000524189 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
IFNA4P05014 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
IFNA4P05014 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
IFNA4P05014 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
IFNA4P05014 KDM6A-213ENST00000611820 5924 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
IFNA4P05014 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
IFNA4P05014 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
IFNA4P05014 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
IFNA4P05014 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
IFNA4P05014 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
IFNA4P05014 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
IFNA4P05014 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
IFNA4P05014 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
IFNA4P05014 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
IFNA4P05014 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
IFNA4P05014 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
IFNA4P05014 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
IFNA4P05014 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
IFNA4P05014 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
IFNA4P05014 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
IFNA4P05014 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
IFNA4P05014 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
IFNA4P05014 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
IFNA4P05014 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
IFNA4P05014 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
IFNA4P05014 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
IFNA4P05014 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
IFNA4P05014 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
IFNA4P05014 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
IFNA4P05014 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.2 ms