Protein–RNA interactions for Protein: O95295

SNAPIN, SNARE-associated protein Snapin, humanhuman

Predictions only

Length 136 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNAPINO95295 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SNAPINO95295 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SNAPINO95295 FOXO3-202ENST00000406360 7341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SNAPINO95295 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SNAPINO95295 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SNAPINO95295 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SNAPINO95295 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SNAPINO95295 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SNAPINO95295 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SNAPINO95295 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SNAPINO95295 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SNAPINO95295 KIAA1324L-207ENST00000444627 3527 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SNAPINO95295 NTRK2-207ENST00000376214 5608 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SNAPINO95295 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SNAPINO95295 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SNAPINO95295 ZNF512B-201ENST00000369888 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SNAPINO95295 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SNAPINO95295 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SNAPINO95295 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SNAPINO95295 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
SNAPINO95295 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SNAPINO95295 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
SNAPINO95295 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
SNAPINO95295 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SNAPINO95295 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SNAPINO95295 LARP4B-211ENST00000612396 8546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
SNAPINO95295 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
SNAPINO95295 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
SNAPINO95295 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
SNAPINO95295 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
SNAPINO95295 RAVER2-202ENST00000371072 4362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SNAPINO95295 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SNAPINO95295 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SNAPINO95295 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SNAPINO95295 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SNAPINO95295 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SNAPINO95295 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SNAPINO95295 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SNAPINO95295 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SNAPINO95295 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
SNAPINO95295 FAM135A-209ENST00000505769 4806 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SNAPINO95295 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
SNAPINO95295 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
SNAPINO95295 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SNAPINO95295 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SNAPINO95295 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SNAPINO95295 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SNAPINO95295 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SNAPINO95295 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
SNAPINO95295 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SNAPINO95295 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SNAPINO95295 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SNAPINO95295 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SNAPINO95295 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SNAPINO95295 LTF-203ENST00000426532 2494 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SNAPINO95295 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SNAPINO95295 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SNAPINO95295 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SNAPINO95295 NRXN1-209ENST00000405581 5078 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SNAPINO95295 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SNAPINO95295 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SNAPINO95295 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SNAPINO95295 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SNAPINO95295 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SNAPINO95295 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SNAPINO95295 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SNAPINO95295 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SNAPINO95295 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SNAPINO95295 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SNAPINO95295 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SNAPINO95295 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SNAPINO95295 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SNAPINO95295 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC16■□□□□ 0.15
SNAPINO95295 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SNAPINO95295 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SNAPINO95295 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SNAPINO95295 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SNAPINO95295 ARFGAP1-201ENST00000353546 2776 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SNAPINO95295 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SNAPINO95295 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SNAPINO95295 ZNF281-201ENST00000294740 4891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SNAPINO95295 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SNAPINO95295 MINDY2-202ENST00000450403 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SNAPINO95295 ARHGAP26-202ENST00000378004 9200 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SNAPINO95295 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SNAPINO95295 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SNAPINO95295 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SNAPINO95295 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SNAPINO95295 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SNAPINO95295 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SNAPINO95295 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SNAPINO95295 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SNAPINO95295 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SNAPINO95295 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SNAPINO95295 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SNAPINO95295 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SNAPINO95295 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SNAPINO95295 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SNAPINO95295 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SNAPINO95295 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.2 ms