Protein–RNA interactions for Protein: O94988

FAM13A, Protein FAM13A, humanhuman

Predictions only

Length 1,023 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM13AO94988 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
FAM13AO94988 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
FAM13AO94988 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
FAM13AO94988 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
FAM13AO94988 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
FAM13AO94988 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
FAM13AO94988 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
FAM13AO94988 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
FAM13AO94988 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
FAM13AO94988 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
FAM13AO94988 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
FAM13AO94988 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
FAM13AO94988 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
FAM13AO94988 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
FAM13AO94988 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
FAM13AO94988 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
FAM13AO94988 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
FAM13AO94988 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
FAM13AO94988 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
FAM13AO94988 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
FAM13AO94988 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
FAM13AO94988 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
FAM13AO94988 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
FAM13AO94988 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
FAM13AO94988 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
FAM13AO94988 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
FAM13AO94988 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
FAM13AO94988 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
FAM13AO94988 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
FAM13AO94988 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
FAM13AO94988 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
FAM13AO94988 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
FAM13AO94988 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
FAM13AO94988 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
FAM13AO94988 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
FAM13AO94988 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
FAM13AO94988 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
FAM13AO94988 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
FAM13AO94988 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
FAM13AO94988 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
FAM13AO94988 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
FAM13AO94988 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
FAM13AO94988 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
FAM13AO94988 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
FAM13AO94988 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
FAM13AO94988 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
FAM13AO94988 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
FAM13AO94988 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
FAM13AO94988 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
FAM13AO94988 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
FAM13AO94988 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
FAM13AO94988 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
FAM13AO94988 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
FAM13AO94988 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
FAM13AO94988 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
FAM13AO94988 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
FAM13AO94988 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
FAM13AO94988 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
FAM13AO94988 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
FAM13AO94988 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
FAM13AO94988 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
FAM13AO94988 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
FAM13AO94988 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
FAM13AO94988 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
FAM13AO94988 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
FAM13AO94988 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
FAM13AO94988 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
FAM13AO94988 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
FAM13AO94988 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
FAM13AO94988 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
FAM13AO94988 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
FAM13AO94988 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
FAM13AO94988 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
FAM13AO94988 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
FAM13AO94988 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
FAM13AO94988 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
FAM13AO94988 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
FAM13AO94988 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
FAM13AO94988 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
FAM13AO94988 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
FAM13AO94988 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
FAM13AO94988 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
FAM13AO94988 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
FAM13AO94988 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
FAM13AO94988 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
FAM13AO94988 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
FAM13AO94988 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
FAM13AO94988 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
FAM13AO94988 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
FAM13AO94988 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
FAM13AO94988 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC22.27■■□□□ 1.16
FAM13AO94988 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
FAM13AO94988 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
FAM13AO94988 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
FAM13AO94988 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
FAM13AO94988 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
FAM13AO94988 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
FAM13AO94988 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
FAM13AO94988 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
FAM13AO94988 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.6 ms