Protein–RNA interactions for Protein: O94769

ECM2, Extracellular matrix protein 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 699 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ECM2O94769 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
ECM2O94769 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
ECM2O94769 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
ECM2O94769 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ECM2O94769 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ECM2O94769 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ECM2O94769 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ECM2O94769 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
ECM2O94769 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ECM2O94769 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ECM2O94769 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ECM2O94769 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ECM2O94769 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ECM2O94769 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ECM2O94769 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ECM2O94769 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
ECM2O94769 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ECM2O94769 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ECM2O94769 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ECM2O94769 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ECM2O94769 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ECM2O94769 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ECM2O94769 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ECM2O94769 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ECM2O94769 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ECM2O94769 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ECM2O94769 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ECM2O94769 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ECM2O94769 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ECM2O94769 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ECM2O94769 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ECM2O94769 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ECM2O94769 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ECM2O94769 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ECM2O94769 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ECM2O94769 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ECM2O94769 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ECM2O94769 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ECM2O94769 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ECM2O94769 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ECM2O94769 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ECM2O94769 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ECM2O94769 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ECM2O94769 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ECM2O94769 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ECM2O94769 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ECM2O94769 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ECM2O94769 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ECM2O94769 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ECM2O94769 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
ECM2O94769 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ECM2O94769 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ECM2O94769 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ECM2O94769 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ECM2O94769 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ECM2O94769 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ECM2O94769 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ECM2O94769 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ECM2O94769 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ECM2O94769 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ECM2O94769 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ECM2O94769 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ECM2O94769 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ECM2O94769 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ECM2O94769 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
ECM2O94769 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ECM2O94769 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ECM2O94769 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
ECM2O94769 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ECM2O94769 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
ECM2O94769 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ECM2O94769 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
ECM2O94769 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ECM2O94769 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ECM2O94769 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ECM2O94769 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ECM2O94769 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ECM2O94769 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ECM2O94769 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ECM2O94769 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ECM2O94769 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ECM2O94769 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
ECM2O94769 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
ECM2O94769 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC23.21■■□□□ 1.31
ECM2O94769 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
ECM2O94769 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
ECM2O94769 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ECM2O94769 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
ECM2O94769 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
ECM2O94769 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
ECM2O94769 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ECM2O94769 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ECM2O94769 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ECM2O94769 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ECM2O94769 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ECM2O94769 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
ECM2O94769 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
ECM2O94769 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
ECM2O94769 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
ECM2O94769 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.9 ms