Protein–RNA interactions for Protein: O43300

LRRTM2, Leucine-rich repeat transmembrane neuronal protein 2, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRTM2O43300 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
LRRTM2O43300 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
LRRTM2O43300 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
LRRTM2O43300 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC18.76■□□□□ 0.59
LRRTM2O43300 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
LRRTM2O43300 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
LRRTM2O43300 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
LRRTM2O43300 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
LRRTM2O43300 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
LRRTM2O43300 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
LRRTM2O43300 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
LRRTM2O43300 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
LRRTM2O43300 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC18.76■□□□□ 0.59
LRRTM2O43300 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
LRRTM2O43300 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
LRRTM2O43300 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
LRRTM2O43300 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
LRRTM2O43300 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
LRRTM2O43300 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
LRRTM2O43300 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC18.75■□□□□ 0.59
LRRTM2O43300 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
LRRTM2O43300 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
LRRTM2O43300 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
LRRTM2O43300 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
LRRTM2O43300 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
LRRTM2O43300 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
LRRTM2O43300 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
LRRTM2O43300 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
LRRTM2O43300 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
LRRTM2O43300 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
LRRTM2O43300 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
LRRTM2O43300 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
LRRTM2O43300 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
LRRTM2O43300 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
LRRTM2O43300 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
LRRTM2O43300 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
LRRTM2O43300 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
LRRTM2O43300 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
LRRTM2O43300 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
LRRTM2O43300 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
LRRTM2O43300 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
LRRTM2O43300 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
LRRTM2O43300 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
LRRTM2O43300 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
LRRTM2O43300 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
LRRTM2O43300 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
LRRTM2O43300 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
LRRTM2O43300 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
LRRTM2O43300 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
LRRTM2O43300 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
LRRTM2O43300 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
LRRTM2O43300 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
LRRTM2O43300 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
LRRTM2O43300 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
LRRTM2O43300 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
LRRTM2O43300 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
LRRTM2O43300 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
LRRTM2O43300 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
LRRTM2O43300 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
LRRTM2O43300 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
LRRTM2O43300 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
LRRTM2O43300 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
LRRTM2O43300 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
LRRTM2O43300 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
LRRTM2O43300 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
LRRTM2O43300 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
LRRTM2O43300 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
LRRTM2O43300 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
LRRTM2O43300 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
LRRTM2O43300 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
LRRTM2O43300 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
LRRTM2O43300 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
LRRTM2O43300 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
LRRTM2O43300 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
LRRTM2O43300 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
LRRTM2O43300 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
LRRTM2O43300 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
LRRTM2O43300 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
LRRTM2O43300 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
LRRTM2O43300 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
LRRTM2O43300 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
LRRTM2O43300 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
LRRTM2O43300 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
LRRTM2O43300 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
LRRTM2O43300 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
LRRTM2O43300 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
LRRTM2O43300 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
LRRTM2O43300 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
LRRTM2O43300 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
LRRTM2O43300 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
LRRTM2O43300 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
LRRTM2O43300 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
LRRTM2O43300 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
LRRTM2O43300 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
LRRTM2O43300 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
LRRTM2O43300 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
LRRTM2O43300 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
LRRTM2O43300 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
LRRTM2O43300 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
LRRTM2O43300 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
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