Protein–RNA interactions for Protein: O15047

SETD1A, Histone-lysine N-methyltransferase SETD1A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,707 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SETD1AO15047 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
SETD1AO15047 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
SETD1AO15047 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
SETD1AO15047 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
SETD1AO15047 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
SETD1AO15047 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
SETD1AO15047 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
SETD1AO15047 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
SETD1AO15047 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
SETD1AO15047 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
SETD1AO15047 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
SETD1AO15047 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC28.41■■■□□ 2.14
SETD1AO15047 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC28.41■■■□□ 2.14
SETD1AO15047 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
SETD1AO15047 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
SETD1AO15047 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
SETD1AO15047 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
SETD1AO15047 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
SETD1AO15047 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
SETD1AO15047 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
SETD1AO15047 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC28.4■■■□□ 2.14
SETD1AO15047 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
SETD1AO15047 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
SETD1AO15047 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
SETD1AO15047 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
SETD1AO15047 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
SETD1AO15047 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
SETD1AO15047 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
SETD1AO15047 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
SETD1AO15047 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
SETD1AO15047 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
SETD1AO15047 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
SETD1AO15047 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
SETD1AO15047 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
SETD1AO15047 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
SETD1AO15047 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
SETD1AO15047 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC28.39■■■□□ 2.14
SETD1AO15047 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
SETD1AO15047 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
SETD1AO15047 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
SETD1AO15047 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC28.39■■■□□ 2.13
SETD1AO15047 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
SETD1AO15047 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
SETD1AO15047 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
SETD1AO15047 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC28.38■■■□□ 2.13
SETD1AO15047 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
SETD1AO15047 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
SETD1AO15047 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
SETD1AO15047 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
SETD1AO15047 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
SETD1AO15047 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
SETD1AO15047 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
SETD1AO15047 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
SETD1AO15047 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
SETD1AO15047 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
SETD1AO15047 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
SETD1AO15047 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
SETD1AO15047 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
SETD1AO15047 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
SETD1AO15047 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
SETD1AO15047 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
SETD1AO15047 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
SETD1AO15047 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
SETD1AO15047 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
SETD1AO15047 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
SETD1AO15047 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
SETD1AO15047 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
SETD1AO15047 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
SETD1AO15047 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
SETD1AO15047 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
SETD1AO15047 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC28.36■■■□□ 2.13
SETD1AO15047 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
SETD1AO15047 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
SETD1AO15047 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
SETD1AO15047 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
SETD1AO15047 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
SETD1AO15047 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
SETD1AO15047 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
SETD1AO15047 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
SETD1AO15047 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC28.35■■■□□ 2.13
SETD1AO15047 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
SETD1AO15047 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
SETD1AO15047 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
SETD1AO15047 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
SETD1AO15047 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
SETD1AO15047 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
SETD1AO15047 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.35■■■□□ 2.13
SETD1AO15047 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
SETD1AO15047 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
SETD1AO15047 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
SETD1AO15047 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
SETD1AO15047 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
SETD1AO15047 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
SETD1AO15047 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
SETD1AO15047 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
SETD1AO15047 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC28.34■■■□□ 2.13
SETD1AO15047 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC28.34■■■□□ 2.13
SETD1AO15047 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
SETD1AO15047 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
SETD1AO15047 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.4 ms