Protein–RNA interactions for Protein: O00443

PIK3C2A, Phosphatidylinositol 4-phosphate 3-kinase C2 domain-containing subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 1,686 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIK3C2AO00443 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
PIK3C2AO00443 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
PIK3C2AO00443 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
PIK3C2AO00443 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.21■■□□□ 1.95
PIK3C2AO00443 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC27.21■■□□□ 1.95
PIK3C2AO00443 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
PIK3C2AO00443 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
PIK3C2AO00443 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
PIK3C2AO00443 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC27.21■■□□□ 1.95
PIK3C2AO00443 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
PIK3C2AO00443 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
PIK3C2AO00443 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
PIK3C2AO00443 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC27.21■■□□□ 1.95
PIK3C2AO00443 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
PIK3C2AO00443 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
PIK3C2AO00443 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
PIK3C2AO00443 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
PIK3C2AO00443 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
PIK3C2AO00443 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
PIK3C2AO00443 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
PIK3C2AO00443 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.95
PIK3C2AO00443 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
PIK3C2AO00443 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
PIK3C2AO00443 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
PIK3C2AO00443 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC27.2■■□□□ 1.94
PIK3C2AO00443 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC27.2■■□□□ 1.94
PIK3C2AO00443 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
PIK3C2AO00443 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
PIK3C2AO00443 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
PIK3C2AO00443 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
PIK3C2AO00443 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
PIK3C2AO00443 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
PIK3C2AO00443 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
PIK3C2AO00443 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
PIK3C2AO00443 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
PIK3C2AO00443 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC27.19■■□□□ 1.94
PIK3C2AO00443 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
PIK3C2AO00443 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
PIK3C2AO00443 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
PIK3C2AO00443 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
PIK3C2AO00443 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
PIK3C2AO00443 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
PIK3C2AO00443 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
PIK3C2AO00443 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
PIK3C2AO00443 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC27.18■■□□□ 1.94
PIK3C2AO00443 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
PIK3C2AO00443 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
PIK3C2AO00443 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
PIK3C2AO00443 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
PIK3C2AO00443 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
PIK3C2AO00443 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
PIK3C2AO00443 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
PIK3C2AO00443 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
PIK3C2AO00443 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
PIK3C2AO00443 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
PIK3C2AO00443 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
PIK3C2AO00443 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
PIK3C2AO00443 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
PIK3C2AO00443 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
PIK3C2AO00443 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
PIK3C2AO00443 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
PIK3C2AO00443 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
PIK3C2AO00443 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC27.17■■□□□ 1.94
PIK3C2AO00443 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
PIK3C2AO00443 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
PIK3C2AO00443 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
PIK3C2AO00443 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
PIK3C2AO00443 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC27.16■■□□□ 1.94
PIK3C2AO00443 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
PIK3C2AO00443 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
PIK3C2AO00443 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
PIK3C2AO00443 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
PIK3C2AO00443 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
PIK3C2AO00443 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
PIK3C2AO00443 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
PIK3C2AO00443 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
PIK3C2AO00443 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
PIK3C2AO00443 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
PIK3C2AO00443 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
PIK3C2AO00443 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
PIK3C2AO00443 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
PIK3C2AO00443 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
PIK3C2AO00443 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
PIK3C2AO00443 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
PIK3C2AO00443 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
PIK3C2AO00443 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
PIK3C2AO00443 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
PIK3C2AO00443 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
PIK3C2AO00443 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
PIK3C2AO00443 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
PIK3C2AO00443 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
PIK3C2AO00443 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
PIK3C2AO00443 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
PIK3C2AO00443 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
PIK3C2AO00443 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
PIK3C2AO00443 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
PIK3C2AO00443 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
PIK3C2AO00443 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
PIK3C2AO00443 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
PIK3C2AO00443 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.6 ms