Protein–RNA interactions for Protein: H3BUS1

SYS1-DBNDD2, SYS1-DBNDD2 readthrough (NMD candidate), humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYS1-DBNDD2H3BUS1 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SYS1-DBNDD2H3BUS1 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SYS1-DBNDD2H3BUS1 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SYS1-DBNDD2H3BUS1 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SYS1-DBNDD2H3BUS1 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SYS1-DBNDD2H3BUS1 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SYS1-DBNDD2H3BUS1 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SYS1-DBNDD2H3BUS1 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SYS1-DBNDD2H3BUS1 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SYS1-DBNDD2H3BUS1 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SYS1-DBNDD2H3BUS1 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SYS1-DBNDD2H3BUS1 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SYS1-DBNDD2H3BUS1 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SYS1-DBNDD2H3BUS1 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
SYS1-DBNDD2H3BUS1 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SYS1-DBNDD2H3BUS1 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
SYS1-DBNDD2H3BUS1 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
SYS1-DBNDD2H3BUS1 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SYS1-DBNDD2H3BUS1 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
SYS1-DBNDD2H3BUS1 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC14.48□□□□□ -0.09
SYS1-DBNDD2H3BUS1 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SYS1-DBNDD2H3BUS1 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC14.48□□□□□ -0.09
SYS1-DBNDD2H3BUS1 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
SYS1-DBNDD2H3BUS1 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SYS1-DBNDD2H3BUS1 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
SYS1-DBNDD2H3BUS1 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
SYS1-DBNDD2H3BUS1 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC14.47□□□□□ -0.09
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
SYS1-DBNDD2H3BUS1 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MDFIC-201ENST00000257724 4598 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
SYS1-DBNDD2H3BUS1 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
SYS1-DBNDD2H3BUS1 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
SYS1-DBNDD2H3BUS1 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
SYS1-DBNDD2H3BUS1 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
SYS1-DBNDD2H3BUS1 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
SYS1-DBNDD2H3BUS1 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
SYS1-DBNDD2H3BUS1 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
SYS1-DBNDD2H3BUS1 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
SYS1-DBNDD2H3BUS1 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
SYS1-DBNDD2H3BUS1 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
SYS1-DBNDD2H3BUS1 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
SYS1-DBNDD2H3BUS1 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
SYS1-DBNDD2H3BUS1 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
SYS1-DBNDD2H3BUS1 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
SYS1-DBNDD2H3BUS1 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
SYS1-DBNDD2H3BUS1 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
SYS1-DBNDD2H3BUS1 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
SYS1-DBNDD2H3BUS1 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
SYS1-DBNDD2H3BUS1 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
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