Protein–RNA interactions for Protein: B2RPK0

HMGB1P1, Putative high mobility group protein B1-like 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMGB1P1B2RPK0 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
HMGB1P1B2RPK0 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
HMGB1P1B2RPK0 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
HMGB1P1B2RPK0 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
HMGB1P1B2RPK0 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
HMGB1P1B2RPK0 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
HMGB1P1B2RPK0 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
HMGB1P1B2RPK0 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
HMGB1P1B2RPK0 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
HMGB1P1B2RPK0 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
HMGB1P1B2RPK0 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
HMGB1P1B2RPK0 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
HMGB1P1B2RPK0 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
HMGB1P1B2RPK0 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
HMGB1P1B2RPK0 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
HMGB1P1B2RPK0 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
HMGB1P1B2RPK0 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
HMGB1P1B2RPK0 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
HMGB1P1B2RPK0 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
HMGB1P1B2RPK0 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
HMGB1P1B2RPK0 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
HMGB1P1B2RPK0 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
HMGB1P1B2RPK0 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
HMGB1P1B2RPK0 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
HMGB1P1B2RPK0 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
HMGB1P1B2RPK0 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
HMGB1P1B2RPK0 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
HMGB1P1B2RPK0 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
HMGB1P1B2RPK0 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
HMGB1P1B2RPK0 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
HMGB1P1B2RPK0 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
HMGB1P1B2RPK0 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
HMGB1P1B2RPK0 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
HMGB1P1B2RPK0 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
HMGB1P1B2RPK0 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
HMGB1P1B2RPK0 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
HMGB1P1B2RPK0 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC20.39■□□□□ 0.85
HMGB1P1B2RPK0 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
HMGB1P1B2RPK0 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
HMGB1P1B2RPK0 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
HMGB1P1B2RPK0 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
HMGB1P1B2RPK0 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
HMGB1P1B2RPK0 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.38■□□□□ 0.85
HMGB1P1B2RPK0 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
HMGB1P1B2RPK0 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
HMGB1P1B2RPK0 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
HMGB1P1B2RPK0 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
HMGB1P1B2RPK0 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
HMGB1P1B2RPK0 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
HMGB1P1B2RPK0 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
HMGB1P1B2RPK0 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
HMGB1P1B2RPK0 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
HMGB1P1B2RPK0 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
HMGB1P1B2RPK0 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
HMGB1P1B2RPK0 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
HMGB1P1B2RPK0 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
HMGB1P1B2RPK0 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
HMGB1P1B2RPK0 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
HMGB1P1B2RPK0 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
HMGB1P1B2RPK0 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
HMGB1P1B2RPK0 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
HMGB1P1B2RPK0 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
HMGB1P1B2RPK0 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
HMGB1P1B2RPK0 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
HMGB1P1B2RPK0 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
HMGB1P1B2RPK0 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
HMGB1P1B2RPK0 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
HMGB1P1B2RPK0 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
HMGB1P1B2RPK0 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
HMGB1P1B2RPK0 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
HMGB1P1B2RPK0 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
HMGB1P1B2RPK0 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
HMGB1P1B2RPK0 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
HMGB1P1B2RPK0 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
HMGB1P1B2RPK0 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
HMGB1P1B2RPK0 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
HMGB1P1B2RPK0 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC20.37■□□□□ 0.85
HMGB1P1B2RPK0 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
HMGB1P1B2RPK0 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
HMGB1P1B2RPK0 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
HMGB1P1B2RPK0 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
HMGB1P1B2RPK0 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
HMGB1P1B2RPK0 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
HMGB1P1B2RPK0 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
HMGB1P1B2RPK0 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
HMGB1P1B2RPK0 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
HMGB1P1B2RPK0 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
HMGB1P1B2RPK0 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
HMGB1P1B2RPK0 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
HMGB1P1B2RPK0 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
HMGB1P1B2RPK0 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
HMGB1P1B2RPK0 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
HMGB1P1B2RPK0 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
HMGB1P1B2RPK0 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
HMGB1P1B2RPK0 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
HMGB1P1B2RPK0 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
HMGB1P1B2RPK0 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
HMGB1P1B2RPK0 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
HMGB1P1B2RPK0 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
HMGB1P1B2RPK0 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.7 ms