Protein–RNA interactions for Protein: A6NKB5

PCNX2, Pecanex-like protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 2,137 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCNX2A6NKB5 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
PCNX2A6NKB5 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
PCNX2A6NKB5 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
PCNX2A6NKB5 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
PCNX2A6NKB5 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
PCNX2A6NKB5 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC19.34■□□□□ 0.69
PCNX2A6NKB5 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
PCNX2A6NKB5 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
PCNX2A6NKB5 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
PCNX2A6NKB5 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
PCNX2A6NKB5 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
PCNX2A6NKB5 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
PCNX2A6NKB5 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
PCNX2A6NKB5 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC19.34■□□□□ 0.69
PCNX2A6NKB5 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
PCNX2A6NKB5 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC19.34■□□□□ 0.69
PCNX2A6NKB5 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
PCNX2A6NKB5 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
PCNX2A6NKB5 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
PCNX2A6NKB5 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
PCNX2A6NKB5 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
PCNX2A6NKB5 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
PCNX2A6NKB5 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
PCNX2A6NKB5 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
PCNX2A6NKB5 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
PCNX2A6NKB5 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
PCNX2A6NKB5 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC19.33■□□□□ 0.69
PCNX2A6NKB5 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
PCNX2A6NKB5 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC19.33■□□□□ 0.69
PCNX2A6NKB5 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
PCNX2A6NKB5 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
PCNX2A6NKB5 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
PCNX2A6NKB5 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
PCNX2A6NKB5 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
PCNX2A6NKB5 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
PCNX2A6NKB5 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
PCNX2A6NKB5 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
PCNX2A6NKB5 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
PCNX2A6NKB5 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC19.32■□□□□ 0.68
PCNX2A6NKB5 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC19.32■□□□□ 0.68
PCNX2A6NKB5 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
PCNX2A6NKB5 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
PCNX2A6NKB5 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
PCNX2A6NKB5 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
PCNX2A6NKB5 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
PCNX2A6NKB5 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
PCNX2A6NKB5 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
PCNX2A6NKB5 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
PCNX2A6NKB5 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
PCNX2A6NKB5 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
PCNX2A6NKB5 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
PCNX2A6NKB5 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PCNX2A6NKB5 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PCNX2A6NKB5 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
PCNX2A6NKB5 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
PCNX2A6NKB5 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
PCNX2A6NKB5 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
PCNX2A6NKB5 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
PCNX2A6NKB5 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
PCNX2A6NKB5 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PCNX2A6NKB5 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
PCNX2A6NKB5 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PCNX2A6NKB5 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
PCNX2A6NKB5 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
PCNX2A6NKB5 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PCNX2A6NKB5 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PCNX2A6NKB5 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PCNX2A6NKB5 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PCNX2A6NKB5 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
PCNX2A6NKB5 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
PCNX2A6NKB5 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
PCNX2A6NKB5 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
PCNX2A6NKB5 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC19.31■□□□□ 0.68
PCNX2A6NKB5 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PCNX2A6NKB5 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PCNX2A6NKB5 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PCNX2A6NKB5 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
PCNX2A6NKB5 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
PCNX2A6NKB5 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PCNX2A6NKB5 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PCNX2A6NKB5 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
PCNX2A6NKB5 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PCNX2A6NKB5 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PCNX2A6NKB5 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PCNX2A6NKB5 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PCNX2A6NKB5 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PCNX2A6NKB5 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
PCNX2A6NKB5 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PCNX2A6NKB5 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PCNX2A6NKB5 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PCNX2A6NKB5 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PCNX2A6NKB5 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PCNX2A6NKB5 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
PCNX2A6NKB5 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
PCNX2A6NKB5 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
PCNX2A6NKB5 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
PCNX2A6NKB5 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC19.3■□□□□ 0.68
PCNX2A6NKB5 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PCNX2A6NKB5 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PCNX2A6NKB5 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.9 ms