Protein–RNA interactions for Protein: A6NGG3

C9orf92, Putative uncharacterized protein C9orf92, humanhuman

Predictions only

Length 77 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf92A6NGG3 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.59
C9orf92A6NGG3 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC11.33□□□□□ -0.6
C9orf92A6NGG3 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
C9orf92A6NGG3 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
C9orf92A6NGG3 CAMK2D-201ENST00000296402 5820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
C9orf92A6NGG3 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
C9orf92A6NGG3 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
C9orf92A6NGG3 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
C9orf92A6NGG3 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
C9orf92A6NGG3 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
C9orf92A6NGG3 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
C9orf92A6NGG3 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
C9orf92A6NGG3 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
C9orf92A6NGG3 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.33□□□□□ -0.6
C9orf92A6NGG3 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
C9orf92A6NGG3 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
C9orf92A6NGG3 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
C9orf92A6NGG3 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
C9orf92A6NGG3 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
C9orf92A6NGG3 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
C9orf92A6NGG3 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
C9orf92A6NGG3 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
C9orf92A6NGG3 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
C9orf92A6NGG3 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
C9orf92A6NGG3 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
C9orf92A6NGG3 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
C9orf92A6NGG3 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
C9orf92A6NGG3 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
C9orf92A6NGG3 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
C9orf92A6NGG3 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
C9orf92A6NGG3 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
C9orf92A6NGG3 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
C9orf92A6NGG3 ITSN2-201ENST00000355123 6300 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
C9orf92A6NGG3 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
C9orf92A6NGG3 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
C9orf92A6NGG3 UNC13A-206ENST00000552293 5314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
C9orf92A6NGG3 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
C9orf92A6NGG3 TTBK2-208ENST00000622375 6891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
C9orf92A6NGG3 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
C9orf92A6NGG3 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
C9orf92A6NGG3 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
C9orf92A6NGG3 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
C9orf92A6NGG3 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
C9orf92A6NGG3 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
C9orf92A6NGG3 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
C9orf92A6NGG3 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
C9orf92A6NGG3 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
C9orf92A6NGG3 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
C9orf92A6NGG3 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC11.32□□□□□ -0.6
C9orf92A6NGG3 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
C9orf92A6NGG3 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
C9orf92A6NGG3 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
C9orf92A6NGG3 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
C9orf92A6NGG3 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
C9orf92A6NGG3 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
C9orf92A6NGG3 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
C9orf92A6NGG3 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
C9orf92A6NGG3 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
C9orf92A6NGG3 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
C9orf92A6NGG3 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
C9orf92A6NGG3 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
C9orf92A6NGG3 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
C9orf92A6NGG3 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
C9orf92A6NGG3 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
C9orf92A6NGG3 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
C9orf92A6NGG3 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
C9orf92A6NGG3 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
C9orf92A6NGG3 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
C9orf92A6NGG3 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
C9orf92A6NGG3 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
C9orf92A6NGG3 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
C9orf92A6NGG3 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
C9orf92A6NGG3 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
C9orf92A6NGG3 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
C9orf92A6NGG3 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
C9orf92A6NGG3 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
C9orf92A6NGG3 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
C9orf92A6NGG3 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
C9orf92A6NGG3 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
C9orf92A6NGG3 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
C9orf92A6NGG3 TSPAN3-201ENST00000267970 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
C9orf92A6NGG3 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
C9orf92A6NGG3 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC11.31□□□□□ -0.6
C9orf92A6NGG3 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
C9orf92A6NGG3 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
C9orf92A6NGG3 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.31□□□□□ -0.6
C9orf92A6NGG3 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC11.31□□□□□ -0.6
C9orf92A6NGG3 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
C9orf92A6NGG3 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
C9orf92A6NGG3 MALT1-202ENST00000348428 9368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
C9orf92A6NGG3 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
C9orf92A6NGG3 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
C9orf92A6NGG3 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
C9orf92A6NGG3 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
C9orf92A6NGG3 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
C9orf92A6NGG3 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
C9orf92A6NGG3 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
C9orf92A6NGG3 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
C9orf92A6NGG3 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
C9orf92A6NGG3 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 88.8 ms