Protein–RNA interactions for Protein: A6NFU8

PGPEP1L, Pyroglutamyl-peptidase 1-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 196 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGPEP1LA6NFU8 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PGPEP1LA6NFU8 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PGPEP1LA6NFU8 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PGPEP1LA6NFU8 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PGPEP1LA6NFU8 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PGPEP1LA6NFU8 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PGPEP1LA6NFU8 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PGPEP1LA6NFU8 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
PGPEP1LA6NFU8 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PGPEP1LA6NFU8 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PGPEP1LA6NFU8 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PGPEP1LA6NFU8 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PGPEP1LA6NFU8 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PGPEP1LA6NFU8 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PGPEP1LA6NFU8 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PGPEP1LA6NFU8 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PGPEP1LA6NFU8 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
PGPEP1LA6NFU8 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PGPEP1LA6NFU8 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PGPEP1LA6NFU8 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PGPEP1LA6NFU8 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PGPEP1LA6NFU8 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PGPEP1LA6NFU8 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PGPEP1LA6NFU8 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PGPEP1LA6NFU8 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PGPEP1LA6NFU8 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PGPEP1LA6NFU8 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PGPEP1LA6NFU8 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PGPEP1LA6NFU8 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PGPEP1LA6NFU8 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PGPEP1LA6NFU8 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PGPEP1LA6NFU8 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PGPEP1LA6NFU8 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
PGPEP1LA6NFU8 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PGPEP1LA6NFU8 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PGPEP1LA6NFU8 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PGPEP1LA6NFU8 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PGPEP1LA6NFU8 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PGPEP1LA6NFU8 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PGPEP1LA6NFU8 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PGPEP1LA6NFU8 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
PGPEP1LA6NFU8 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PGPEP1LA6NFU8 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PGPEP1LA6NFU8 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PGPEP1LA6NFU8 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PGPEP1LA6NFU8 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PGPEP1LA6NFU8 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
PGPEP1LA6NFU8 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PGPEP1LA6NFU8 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PGPEP1LA6NFU8 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PGPEP1LA6NFU8 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PGPEP1LA6NFU8 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PGPEP1LA6NFU8 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PGPEP1LA6NFU8 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PGPEP1LA6NFU8 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PGPEP1LA6NFU8 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PGPEP1LA6NFU8 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PGPEP1LA6NFU8 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PGPEP1LA6NFU8 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PGPEP1LA6NFU8 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
PGPEP1LA6NFU8 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PGPEP1LA6NFU8 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PGPEP1LA6NFU8 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PGPEP1LA6NFU8 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PGPEP1LA6NFU8 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PGPEP1LA6NFU8 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PGPEP1LA6NFU8 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PGPEP1LA6NFU8 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PGPEP1LA6NFU8 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PGPEP1LA6NFU8 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
PGPEP1LA6NFU8 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PGPEP1LA6NFU8 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PGPEP1LA6NFU8 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PGPEP1LA6NFU8 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PGPEP1LA6NFU8 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PGPEP1LA6NFU8 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
PGPEP1LA6NFU8 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PGPEP1LA6NFU8 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PGPEP1LA6NFU8 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
PGPEP1LA6NFU8 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PGPEP1LA6NFU8 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PGPEP1LA6NFU8 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PGPEP1LA6NFU8 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PGPEP1LA6NFU8 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PGPEP1LA6NFU8 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PGPEP1LA6NFU8 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PGPEP1LA6NFU8 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PGPEP1LA6NFU8 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PGPEP1LA6NFU8 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PGPEP1LA6NFU8 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PGPEP1LA6NFU8 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PGPEP1LA6NFU8 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PGPEP1LA6NFU8 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PGPEP1LA6NFU8 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PGPEP1LA6NFU8 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PGPEP1LA6NFU8 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PGPEP1LA6NFU8 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
PGPEP1LA6NFU8 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC15.46■□□□□ 0.06
PGPEP1LA6NFU8 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
PGPEP1LA6NFU8 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.8 ms