Protein–RNA interactions for Protein: A3QJZ6

PRAMEF22, PRAME family member 22, humanhuman

Predictions only

Length 481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAMEF22A3QJZ6 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
PRAMEF22A3QJZ6 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
PRAMEF22A3QJZ6 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC25.8■■□□□ 1.72
PRAMEF22A3QJZ6 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
PRAMEF22A3QJZ6 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
PRAMEF22A3QJZ6 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
PRAMEF22A3QJZ6 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
PRAMEF22A3QJZ6 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
PRAMEF22A3QJZ6 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
PRAMEF22A3QJZ6 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
PRAMEF22A3QJZ6 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
PRAMEF22A3QJZ6 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
PRAMEF22A3QJZ6 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
PRAMEF22A3QJZ6 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
PRAMEF22A3QJZ6 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
PRAMEF22A3QJZ6 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
PRAMEF22A3QJZ6 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
PRAMEF22A3QJZ6 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
PRAMEF22A3QJZ6 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
PRAMEF22A3QJZ6 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
PRAMEF22A3QJZ6 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
PRAMEF22A3QJZ6 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
PRAMEF22A3QJZ6 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
PRAMEF22A3QJZ6 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
PRAMEF22A3QJZ6 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
PRAMEF22A3QJZ6 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC25.79■■□□□ 1.72
PRAMEF22A3QJZ6 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
PRAMEF22A3QJZ6 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
PRAMEF22A3QJZ6 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
PRAMEF22A3QJZ6 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
PRAMEF22A3QJZ6 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
PRAMEF22A3QJZ6 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
PRAMEF22A3QJZ6 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
PRAMEF22A3QJZ6 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
PRAMEF22A3QJZ6 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
PRAMEF22A3QJZ6 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
PRAMEF22A3QJZ6 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
PRAMEF22A3QJZ6 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
PRAMEF22A3QJZ6 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
PRAMEF22A3QJZ6 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
PRAMEF22A3QJZ6 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
PRAMEF22A3QJZ6 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
PRAMEF22A3QJZ6 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
PRAMEF22A3QJZ6 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
PRAMEF22A3QJZ6 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
PRAMEF22A3QJZ6 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
PRAMEF22A3QJZ6 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
PRAMEF22A3QJZ6 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
PRAMEF22A3QJZ6 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
PRAMEF22A3QJZ6 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.78■■□□□ 1.72
PRAMEF22A3QJZ6 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
PRAMEF22A3QJZ6 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
PRAMEF22A3QJZ6 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
PRAMEF22A3QJZ6 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
PRAMEF22A3QJZ6 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
PRAMEF22A3QJZ6 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
PRAMEF22A3QJZ6 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
PRAMEF22A3QJZ6 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
PRAMEF22A3QJZ6 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
PRAMEF22A3QJZ6 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
PRAMEF22A3QJZ6 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
PRAMEF22A3QJZ6 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
PRAMEF22A3QJZ6 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
PRAMEF22A3QJZ6 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
PRAMEF22A3QJZ6 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
PRAMEF22A3QJZ6 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
PRAMEF22A3QJZ6 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.72
PRAMEF22A3QJZ6 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
PRAMEF22A3QJZ6 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
PRAMEF22A3QJZ6 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
PRAMEF22A3QJZ6 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
PRAMEF22A3QJZ6 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
PRAMEF22A3QJZ6 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
PRAMEF22A3QJZ6 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
PRAMEF22A3QJZ6 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
PRAMEF22A3QJZ6 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
PRAMEF22A3QJZ6 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
PRAMEF22A3QJZ6 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
PRAMEF22A3QJZ6 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
PRAMEF22A3QJZ6 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
PRAMEF22A3QJZ6 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
PRAMEF22A3QJZ6 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
PRAMEF22A3QJZ6 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
PRAMEF22A3QJZ6 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
PRAMEF22A3QJZ6 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
PRAMEF22A3QJZ6 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
PRAMEF22A3QJZ6 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
PRAMEF22A3QJZ6 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
PRAMEF22A3QJZ6 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC25.75■■□□□ 1.71
PRAMEF22A3QJZ6 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
PRAMEF22A3QJZ6 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
PRAMEF22A3QJZ6 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
PRAMEF22A3QJZ6 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PRAMEF22A3QJZ6 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PRAMEF22A3QJZ6 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
PRAMEF22A3QJZ6 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
PRAMEF22A3QJZ6 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
PRAMEF22A3QJZ6 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PRAMEF22A3QJZ6 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC25.74■■□□□ 1.71
PRAMEF22A3QJZ6 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.8 ms