Protein–RNA interactions for Protein: A1L190

SYCE3, Synaptonemal complex central element protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 88 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYCE3A1L190 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SYCE3A1L190 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SYCE3A1L190 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SYCE3A1L190 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SYCE3A1L190 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SYCE3A1L190 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SYCE3A1L190 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SYCE3A1L190 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SYCE3A1L190 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SYCE3A1L190 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SYCE3A1L190 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SYCE3A1L190 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SYCE3A1L190 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SYCE3A1L190 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SYCE3A1L190 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SYCE3A1L190 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SYCE3A1L190 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SYCE3A1L190 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SYCE3A1L190 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SYCE3A1L190 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SYCE3A1L190 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
SYCE3A1L190 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SYCE3A1L190 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SYCE3A1L190 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SYCE3A1L190 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SYCE3A1L190 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SYCE3A1L190 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SYCE3A1L190 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SYCE3A1L190 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SYCE3A1L190 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
SYCE3A1L190 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SYCE3A1L190 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SYCE3A1L190 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SYCE3A1L190 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SYCE3A1L190 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SYCE3A1L190 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
SYCE3A1L190 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SYCE3A1L190 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SYCE3A1L190 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
SYCE3A1L190 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SYCE3A1L190 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SYCE3A1L190 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SYCE3A1L190 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SYCE3A1L190 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SYCE3A1L190 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SYCE3A1L190 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SYCE3A1L190 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SYCE3A1L190 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SYCE3A1L190 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SYCE3A1L190 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SYCE3A1L190 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SYCE3A1L190 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SYCE3A1L190 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SYCE3A1L190 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SYCE3A1L190 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SYCE3A1L190 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SYCE3A1L190 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SYCE3A1L190 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SYCE3A1L190 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SYCE3A1L190 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SYCE3A1L190 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SYCE3A1L190 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SYCE3A1L190 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SYCE3A1L190 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
SYCE3A1L190 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
SYCE3A1L190 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SYCE3A1L190 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SYCE3A1L190 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SYCE3A1L190 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SYCE3A1L190 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SYCE3A1L190 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SYCE3A1L190 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SYCE3A1L190 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SYCE3A1L190 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SYCE3A1L190 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SYCE3A1L190 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SYCE3A1L190 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
SYCE3A1L190 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SYCE3A1L190 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SYCE3A1L190 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SYCE3A1L190 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SYCE3A1L190 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
SYCE3A1L190 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SYCE3A1L190 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SYCE3A1L190 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SYCE3A1L190 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SYCE3A1L190 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SYCE3A1L190 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SYCE3A1L190 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SYCE3A1L190 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SYCE3A1L190 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SYCE3A1L190 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SYCE3A1L190 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SYCE3A1L190 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SYCE3A1L190 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SYCE3A1L190 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SYCE3A1L190 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SYCE3A1L190 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
SYCE3A1L190 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
SYCE3A1L190 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.5 ms