Protein–RNA interactions for Protein: Q16654

PDK4, [Pyruvate dehydrogenase (acetyl-transferring)] kinase isozyme 4, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 411 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDK4Q16654 OR2AT4-201ENST00000305159 1042 ntAPPRIS P1 BASIC7.74□□□□□ -1.17
PDK4Q16654 SNORA71D-201ENST00000363484 134 ntBASIC7.74□□□□□ -1.17
PDK4Q16654 TMEM126B-202ENST00000393375 1210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
PDK4Q16654 H2AFZP3-201ENST00000394213 387 ntBASIC7.74□□□□□ -1.17
PDK4Q16654 UPF3AP1-201ENST00000413731 1126 ntBASIC7.74□□□□□ -1.17
PDK4Q16654 AC012594.1-235ENST00000424391 727 ntTSL 5 BASIC7.74□□□□□ -1.17
PDK4Q16654 AC126124.1-201ENST00000426104 185 ntBASIC7.74□□□□□ -1.17
PDK4Q16654 Z98949.3-201ENST00000436423 472 ntTSL 5 BASIC7.74□□□□□ -1.17
PDK4Q16654 AL135908.1-202ENST00000454135 562 ntTSL 2 BASIC7.74□□□□□ -1.17
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PDK4Q16654 AL449212.1-201ENST00000499853 517 ntBASIC7.74□□□□□ -1.17
PDK4Q16654 AC008592.1-201ENST00000503091 665 ntTSL 3 BASIC7.74□□□□□ -1.17
PDK4Q16654 CC2D2A-205ENST00000503658 605 ntTSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
PDK4Q16654 AC106799.2-201ENST00000507435 721 ntTSL 5 BASIC7.74□□□□□ -1.17
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PDK4Q16654 AP001922.2-201ENST00000530435 390 ntTSL 3 BASIC7.74□□□□□ -1.17
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PDK4Q16654 PRR13-205ENST00000549068 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.74□□□□□ -1.17
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PDK4Q16654 RNVU1-19-201ENST00000613023 167 ntBASIC7.74□□□□□ -1.17
PDK4Q16654 AC005609.2-201ENST00000623320 592 ntBASIC7.74□□□□□ -1.17
PDK4Q16654 AC012594.1-254ENST00000628002 438 ntTSL 5 BASIC7.74□□□□□ -1.17
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PDK4Q16654 AF064858.1-201ENST00000417335 1412 ntTSL 5 BASIC7.74□□□□□ -1.17
PDK4Q16654 NRG3-206ENST00000545131 2713 ntTSL 5 BASIC7.74□□□□□ -1.17
PDK4Q16654 TTC39B-208ENST00000512701 10483 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC7.74□□□□□ -1.17
PDK4Q16654 RAB11A-201ENST00000261890 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
PDK4Q16654 LARP7-201ENST00000324052 2164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.74□□□□□ -1.17
PDK4Q16654 ADAM3A-207ENST00000490268 2627 ntTSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
PDK4Q16654 BEST3-212ENST00000553096 2929 ntTSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
PDK4Q16654 BDNF-207ENST00000395986 3979 ntTSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
PDK4Q16654 CFI-207ENST00000618244 1345 ntTSL 5 BASIC7.74□□□□□ -1.17
PDK4Q16654 IQCA1-204ENST00000409907 3281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
PDK4Q16654 AL591379.1-201ENST00000315293 3739 ntTSL 2 BASIC7.74□□□□□ -1.17
PDK4Q16654 PIGN-221ENST00000638183 4046 ntTSL 5 BASIC7.74□□□□□ -1.17
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PDK4Q16654 TTTY2B-201ENST00000450591 3168 ntTSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
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PDK4Q16654 AC137735.1-201ENST00000581911 419 ntTSL 3 BASIC7.73□□□□□ -1.17
PDK4Q16654 AC011933.4-201ENST00000585081 403 ntTSL 3 BASIC7.73□□□□□ -1.17
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PDK4Q16654 MIR6834-201ENST00000622807 81 ntBASIC7.73□□□□□ -1.17
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PDK4Q16654 TTTY15-202ENST00000440408 5284 ntTSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
PDK4Q16654 PHKB-201ENST00000299167 5464 ntTSL 5 BASIC7.73□□□□□ -1.17
PDK4Q16654 KCNMA1-266ENST00000639601 11920 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.73□□□□□ -1.17
PDK4Q16654 TRIM6-202ENST00000380097 3403 ntTSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
PDK4Q16654 DIS3-201ENST00000377767 10604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
PDK4Q16654 DDX11L16-201ENST00000507418 1306 ntBASIC7.73□□□□□ -1.17
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PDK4Q16654 PDE6A-205ENST00000617647 4039 ntTSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
PDK4Q16654 BFAR-201ENST00000261658 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
PDK4Q16654 DDX58-202ENST00000379883 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
PDK4Q16654 HEPH-201ENST00000336279 4228 ntTSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
PDK4Q16654 LUZP1-202ENST00000314174 3715 ntTSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
PDK4Q16654 ATP2B4-201ENST00000341360 4658 ntTSL 1 (best) BASIC7.72□□□□□ -1.17
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