Protein–RNA interactions for Protein: R4GMW8

BIVM-ERCC5, BIVM-ERCC5 readthrough, humanhuman

Predictions only

Length 1,640 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BIVM-ERCC5R4GMW8 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
BIVM-ERCC5R4GMW8 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
BIVM-ERCC5R4GMW8 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
BIVM-ERCC5R4GMW8 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC33.9■■■■□ 3.02
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC33.9■■■■□ 3.02
BIVM-ERCC5R4GMW8 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC33.9■■■■□ 3.02
BIVM-ERCC5R4GMW8 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
BIVM-ERCC5R4GMW8 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
BIVM-ERCC5R4GMW8 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
BIVM-ERCC5R4GMW8 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
BIVM-ERCC5R4GMW8 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.89■■■■□ 3.02
BIVM-ERCC5R4GMW8 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
BIVM-ERCC5R4GMW8 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
BIVM-ERCC5R4GMW8 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC33.89■■■■□ 3.02
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC33.89■■■■□ 3.02
BIVM-ERCC5R4GMW8 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
BIVM-ERCC5R4GMW8 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC33.88■■■■□ 3.01
BIVM-ERCC5R4GMW8 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC33.88■■■■□ 3.01
BIVM-ERCC5R4GMW8 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
BIVM-ERCC5R4GMW8 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
BIVM-ERCC5R4GMW8 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
BIVM-ERCC5R4GMW8 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
BIVM-ERCC5R4GMW8 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
BIVM-ERCC5R4GMW8 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC33.88■■■■□ 3.01
BIVM-ERCC5R4GMW8 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
BIVM-ERCC5R4GMW8 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC33.88■■■■□ 3.01
BIVM-ERCC5R4GMW8 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
BIVM-ERCC5R4GMW8 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
BIVM-ERCC5R4GMW8 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC33.87■■■■□ 3.01
BIVM-ERCC5R4GMW8 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
BIVM-ERCC5R4GMW8 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.87■■■■□ 3.01
BIVM-ERCC5R4GMW8 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
BIVM-ERCC5R4GMW8 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.87■■■■□ 3.01
BIVM-ERCC5R4GMW8 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
BIVM-ERCC5R4GMW8 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC33.87■■■■□ 3.01
BIVM-ERCC5R4GMW8 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
BIVM-ERCC5R4GMW8 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC33.86■■■■□ 3.01
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC33.86■■■■□ 3.01
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC33.86■■■■□ 3.01
BIVM-ERCC5R4GMW8 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
BIVM-ERCC5R4GMW8 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
BIVM-ERCC5R4GMW8 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC33.86■■■■□ 3.01
BIVM-ERCC5R4GMW8 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
BIVM-ERCC5R4GMW8 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
BIVM-ERCC5R4GMW8 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC33.86■■■■□ 3.01
BIVM-ERCC5R4GMW8 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC33.86■■■■□ 3.01
BIVM-ERCC5R4GMW8 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC33.86■■■■□ 3.01
BIVM-ERCC5R4GMW8 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
BIVM-ERCC5R4GMW8 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.85■■■■□ 3.01
BIVM-ERCC5R4GMW8 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
BIVM-ERCC5R4GMW8 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
BIVM-ERCC5R4GMW8 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
BIVM-ERCC5R4GMW8 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC33.85■■■■□ 3.01
BIVM-ERCC5R4GMW8 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
BIVM-ERCC5R4GMW8 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
BIVM-ERCC5R4GMW8 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC33.85■■■■□ 3.01
BIVM-ERCC5R4GMW8 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC33.85■■■■□ 3.01
BIVM-ERCC5R4GMW8 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC33.84■■■■□ 3.01
BIVM-ERCC5R4GMW8 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
BIVM-ERCC5R4GMW8 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.84■■■■□ 3.01
BIVM-ERCC5R4GMW8 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
BIVM-ERCC5R4GMW8 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.84■■■■□ 3.01
BIVM-ERCC5R4GMW8 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC33.84■■■■□ 3.01
BIVM-ERCC5R4GMW8 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC33.84■■■■□ 3.01
BIVM-ERCC5R4GMW8 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
BIVM-ERCC5R4GMW8 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
BIVM-ERCC5R4GMW8 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
BIVM-ERCC5R4GMW8 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
BIVM-ERCC5R4GMW8 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
BIVM-ERCC5R4GMW8 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.83■■■■□ 3.01
BIVM-ERCC5R4GMW8 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.83■■■■□ 3.01
BIVM-ERCC5R4GMW8 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
BIVM-ERCC5R4GMW8 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC33.83■■■■□ 3.01
BIVM-ERCC5R4GMW8 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
BIVM-ERCC5R4GMW8 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
BIVM-ERCC5R4GMW8 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
BIVM-ERCC5R4GMW8 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
BIVM-ERCC5R4GMW8 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC33.82■■■■□ 3.01
BIVM-ERCC5R4GMW8 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC33.82■■■■□ 3.01
BIVM-ERCC5R4GMW8 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC33.82■■■■□ 3.01
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC33.82■■■■□ 3.01
BIVM-ERCC5R4GMW8 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC33.82■■■■□ 3
BIVM-ERCC5R4GMW8 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC33.82■■■■□ 3
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC33.82■■■■□ 3
BIVM-ERCC5R4GMW8 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC33.82■■■■□ 3
BIVM-ERCC5R4GMW8 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC33.82■■■■□ 3
BIVM-ERCC5R4GMW8 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3
BIVM-ERCC5R4GMW8 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC33.82■■■■□ 3
BIVM-ERCC5R4GMW8 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC33.82■■■■□ 3
BIVM-ERCC5R4GMW8 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3
BIVM-ERCC5R4GMW8 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
BIVM-ERCC5R4GMW8 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
BIVM-ERCC5R4GMW8 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.81■■■■□ 3
BIVM-ERCC5R4GMW8 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
BIVM-ERCC5R4GMW8 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC33.81■■■■□ 3
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC33.8■■■■□ 3
BIVM-ERCC5R4GMW8 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC33.8■■■■□ 3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 74.9 ms