Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5Q9

GTF3C3, General transcription factor 3C polypeptide 3, humanhuman

Predictions only

Length 886 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF3C3Q9Y5Q9 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
GTF3C3Q9Y5Q9 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
GTF3C3Q9Y5Q9 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
GTF3C3Q9Y5Q9 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
GTF3C3Q9Y5Q9 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
GTF3C3Q9Y5Q9 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
GTF3C3Q9Y5Q9 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
GTF3C3Q9Y5Q9 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
GTF3C3Q9Y5Q9 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
GTF3C3Q9Y5Q9 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
GTF3C3Q9Y5Q9 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
GTF3C3Q9Y5Q9 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
GTF3C3Q9Y5Q9 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
GTF3C3Q9Y5Q9 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
GTF3C3Q9Y5Q9 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
GTF3C3Q9Y5Q9 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC27■■□□□ 1.91
GTF3C3Q9Y5Q9 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
GTF3C3Q9Y5Q9 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC27■■□□□ 1.91
GTF3C3Q9Y5Q9 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
GTF3C3Q9Y5Q9 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
GTF3C3Q9Y5Q9 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
GTF3C3Q9Y5Q9 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
GTF3C3Q9Y5Q9 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
GTF3C3Q9Y5Q9 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
GTF3C3Q9Y5Q9 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
GTF3C3Q9Y5Q9 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
GTF3C3Q9Y5Q9 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
GTF3C3Q9Y5Q9 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
GTF3C3Q9Y5Q9 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
GTF3C3Q9Y5Q9 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
GTF3C3Q9Y5Q9 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
GTF3C3Q9Y5Q9 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
GTF3C3Q9Y5Q9 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
GTF3C3Q9Y5Q9 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
GTF3C3Q9Y5Q9 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
GTF3C3Q9Y5Q9 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
GTF3C3Q9Y5Q9 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
GTF3C3Q9Y5Q9 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
GTF3C3Q9Y5Q9 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
GTF3C3Q9Y5Q9 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
GTF3C3Q9Y5Q9 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
GTF3C3Q9Y5Q9 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC26.98■■□□□ 1.91
GTF3C3Q9Y5Q9 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
GTF3C3Q9Y5Q9 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
GTF3C3Q9Y5Q9 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
GTF3C3Q9Y5Q9 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
GTF3C3Q9Y5Q9 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
GTF3C3Q9Y5Q9 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
GTF3C3Q9Y5Q9 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
GTF3C3Q9Y5Q9 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
GTF3C3Q9Y5Q9 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
GTF3C3Q9Y5Q9 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
GTF3C3Q9Y5Q9 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
GTF3C3Q9Y5Q9 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
GTF3C3Q9Y5Q9 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
GTF3C3Q9Y5Q9 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
GTF3C3Q9Y5Q9 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
GTF3C3Q9Y5Q9 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
GTF3C3Q9Y5Q9 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
GTF3C3Q9Y5Q9 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
GTF3C3Q9Y5Q9 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
GTF3C3Q9Y5Q9 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
GTF3C3Q9Y5Q9 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
GTF3C3Q9Y5Q9 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
GTF3C3Q9Y5Q9 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
GTF3C3Q9Y5Q9 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
GTF3C3Q9Y5Q9 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
GTF3C3Q9Y5Q9 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
GTF3C3Q9Y5Q9 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
GTF3C3Q9Y5Q9 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
GTF3C3Q9Y5Q9 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
GTF3C3Q9Y5Q9 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
GTF3C3Q9Y5Q9 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
GTF3C3Q9Y5Q9 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
GTF3C3Q9Y5Q9 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
GTF3C3Q9Y5Q9 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
GTF3C3Q9Y5Q9 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
GTF3C3Q9Y5Q9 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.96■■□□□ 1.91
GTF3C3Q9Y5Q9 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.91
GTF3C3Q9Y5Q9 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC26.95■■□□□ 1.91
GTF3C3Q9Y5Q9 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
GTF3C3Q9Y5Q9 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
GTF3C3Q9Y5Q9 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.91
GTF3C3Q9Y5Q9 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
GTF3C3Q9Y5Q9 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
GTF3C3Q9Y5Q9 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
GTF3C3Q9Y5Q9 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
GTF3C3Q9Y5Q9 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
GTF3C3Q9Y5Q9 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
GTF3C3Q9Y5Q9 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
GTF3C3Q9Y5Q9 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
GTF3C3Q9Y5Q9 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
GTF3C3Q9Y5Q9 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
GTF3C3Q9Y5Q9 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
GTF3C3Q9Y5Q9 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
GTF3C3Q9Y5Q9 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
GTF3C3Q9Y5Q9 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
GTF3C3Q9Y5Q9 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC26.94■■□□□ 1.9
GTF3C3Q9Y5Q9 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
GTF3C3Q9Y5Q9 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.8 ms