Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4C0

NRXN3, Neurexin-3, humanhuman

Predictions only

Length 1,643 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NRXN3Q9Y4C0 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
NRXN3Q9Y4C0 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
NRXN3Q9Y4C0 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
NRXN3Q9Y4C0 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
NRXN3Q9Y4C0 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
NRXN3Q9Y4C0 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
NRXN3Q9Y4C0 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
NRXN3Q9Y4C0 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
NRXN3Q9Y4C0 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC28.54■■■□□ 2.16
NRXN3Q9Y4C0 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
NRXN3Q9Y4C0 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
NRXN3Q9Y4C0 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
NRXN3Q9Y4C0 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
NRXN3Q9Y4C0 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
NRXN3Q9Y4C0 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
NRXN3Q9Y4C0 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
NRXN3Q9Y4C0 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
NRXN3Q9Y4C0 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC28.54■■■□□ 2.16
NRXN3Q9Y4C0 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
NRXN3Q9Y4C0 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
NRXN3Q9Y4C0 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
NRXN3Q9Y4C0 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
NRXN3Q9Y4C0 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
NRXN3Q9Y4C0 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
NRXN3Q9Y4C0 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC28.53■■■□□ 2.16
NRXN3Q9Y4C0 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
NRXN3Q9Y4C0 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
NRXN3Q9Y4C0 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
NRXN3Q9Y4C0 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
NRXN3Q9Y4C0 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
NRXN3Q9Y4C0 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
NRXN3Q9Y4C0 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
NRXN3Q9Y4C0 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
NRXN3Q9Y4C0 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC28.52■■■□□ 2.16
NRXN3Q9Y4C0 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
NRXN3Q9Y4C0 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
NRXN3Q9Y4C0 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC28.52■■■□□ 2.16
NRXN3Q9Y4C0 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
NRXN3Q9Y4C0 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC28.52■■■□□ 2.16
NRXN3Q9Y4C0 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
NRXN3Q9Y4C0 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
NRXN3Q9Y4C0 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC28.52■■■□□ 2.16
NRXN3Q9Y4C0 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
NRXN3Q9Y4C0 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
NRXN3Q9Y4C0 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
NRXN3Q9Y4C0 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
NRXN3Q9Y4C0 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.52■■■□□ 2.16
NRXN3Q9Y4C0 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
NRXN3Q9Y4C0 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
NRXN3Q9Y4C0 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC28.51■■■□□ 2.15
NRXN3Q9Y4C0 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
NRXN3Q9Y4C0 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
NRXN3Q9Y4C0 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
NRXN3Q9Y4C0 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
NRXN3Q9Y4C0 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
NRXN3Q9Y4C0 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
NRXN3Q9Y4C0 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
NRXN3Q9Y4C0 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
NRXN3Q9Y4C0 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
NRXN3Q9Y4C0 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC28.51■■■□□ 2.15
NRXN3Q9Y4C0 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
NRXN3Q9Y4C0 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
NRXN3Q9Y4C0 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
NRXN3Q9Y4C0 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC28.51■■■□□ 2.15
NRXN3Q9Y4C0 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
NRXN3Q9Y4C0 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
NRXN3Q9Y4C0 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
NRXN3Q9Y4C0 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
NRXN3Q9Y4C0 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
NRXN3Q9Y4C0 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
NRXN3Q9Y4C0 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
NRXN3Q9Y4C0 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
NRXN3Q9Y4C0 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
NRXN3Q9Y4C0 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
NRXN3Q9Y4C0 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
NRXN3Q9Y4C0 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
NRXN3Q9Y4C0 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
NRXN3Q9Y4C0 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC28.49■■■□□ 2.15
NRXN3Q9Y4C0 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
NRXN3Q9Y4C0 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
NRXN3Q9Y4C0 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC28.49■■■□□ 2.15
NRXN3Q9Y4C0 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
NRXN3Q9Y4C0 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
NRXN3Q9Y4C0 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC28.49■■■□□ 2.15
NRXN3Q9Y4C0 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
NRXN3Q9Y4C0 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
NRXN3Q9Y4C0 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
NRXN3Q9Y4C0 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
NRXN3Q9Y4C0 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
NRXN3Q9Y4C0 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
NRXN3Q9Y4C0 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
NRXN3Q9Y4C0 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC28.48■■■□□ 2.15
NRXN3Q9Y4C0 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
NRXN3Q9Y4C0 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
NRXN3Q9Y4C0 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
NRXN3Q9Y4C0 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
NRXN3Q9Y4C0 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
NRXN3Q9Y4C0 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
NRXN3Q9Y4C0 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC28.47■■■□□ 2.15
NRXN3Q9Y4C0 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.6 ms