Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y496

KIF3A, Kinesin-like protein KIF3A, humanhuman

Predictions only

Length 699 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KIF3AQ9Y496 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
KIF3AQ9Y496 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
KIF3AQ9Y496 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
KIF3AQ9Y496 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
KIF3AQ9Y496 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
KIF3AQ9Y496 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
KIF3AQ9Y496 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
KIF3AQ9Y496 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
KIF3AQ9Y496 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
KIF3AQ9Y496 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
KIF3AQ9Y496 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
KIF3AQ9Y496 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
KIF3AQ9Y496 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
KIF3AQ9Y496 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.37
KIF3AQ9Y496 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
KIF3AQ9Y496 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
KIF3AQ9Y496 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
KIF3AQ9Y496 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
KIF3AQ9Y496 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
KIF3AQ9Y496 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
KIF3AQ9Y496 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
KIF3AQ9Y496 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
KIF3AQ9Y496 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
KIF3AQ9Y496 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC23.58■■□□□ 1.36
KIF3AQ9Y496 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
KIF3AQ9Y496 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
KIF3AQ9Y496 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
KIF3AQ9Y496 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
KIF3AQ9Y496 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
KIF3AQ9Y496 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
KIF3AQ9Y496 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
KIF3AQ9Y496 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
KIF3AQ9Y496 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
KIF3AQ9Y496 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
KIF3AQ9Y496 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
KIF3AQ9Y496 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
KIF3AQ9Y496 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
KIF3AQ9Y496 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
KIF3AQ9Y496 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
KIF3AQ9Y496 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
KIF3AQ9Y496 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
KIF3AQ9Y496 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
KIF3AQ9Y496 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
KIF3AQ9Y496 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
KIF3AQ9Y496 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
KIF3AQ9Y496 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
KIF3AQ9Y496 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
KIF3AQ9Y496 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
KIF3AQ9Y496 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
KIF3AQ9Y496 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
KIF3AQ9Y496 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
KIF3AQ9Y496 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
KIF3AQ9Y496 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
KIF3AQ9Y496 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
KIF3AQ9Y496 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
KIF3AQ9Y496 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
KIF3AQ9Y496 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
KIF3AQ9Y496 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
KIF3AQ9Y496 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
KIF3AQ9Y496 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
KIF3AQ9Y496 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
KIF3AQ9Y496 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
KIF3AQ9Y496 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
KIF3AQ9Y496 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
KIF3AQ9Y496 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
KIF3AQ9Y496 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
KIF3AQ9Y496 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
KIF3AQ9Y496 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
KIF3AQ9Y496 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
KIF3AQ9Y496 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
KIF3AQ9Y496 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
KIF3AQ9Y496 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
KIF3AQ9Y496 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
KIF3AQ9Y496 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
KIF3AQ9Y496 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
KIF3AQ9Y496 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
KIF3AQ9Y496 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
KIF3AQ9Y496 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC23.55■■□□□ 1.36
KIF3AQ9Y496 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
KIF3AQ9Y496 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
KIF3AQ9Y496 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
KIF3AQ9Y496 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
KIF3AQ9Y496 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
KIF3AQ9Y496 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
KIF3AQ9Y496 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
KIF3AQ9Y496 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
KIF3AQ9Y496 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
KIF3AQ9Y496 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
KIF3AQ9Y496 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
KIF3AQ9Y496 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
KIF3AQ9Y496 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
KIF3AQ9Y496 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
KIF3AQ9Y496 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
KIF3AQ9Y496 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
KIF3AQ9Y496 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
KIF3AQ9Y496 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
KIF3AQ9Y496 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
KIF3AQ9Y496 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.54■■□□□ 1.36
KIF3AQ9Y496 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
KIF3AQ9Y496 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.8 ms