Protein–RNA interactions for Protein: Q9UQ05

KCNH4, Potassium voltage-gated channel subfamily H member 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,017 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNH4Q9UQ05 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
KCNH4Q9UQ05 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
KCNH4Q9UQ05 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
KCNH4Q9UQ05 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
KCNH4Q9UQ05 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
KCNH4Q9UQ05 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
KCNH4Q9UQ05 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
KCNH4Q9UQ05 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
KCNH4Q9UQ05 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
KCNH4Q9UQ05 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
KCNH4Q9UQ05 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
KCNH4Q9UQ05 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
KCNH4Q9UQ05 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
KCNH4Q9UQ05 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
KCNH4Q9UQ05 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
KCNH4Q9UQ05 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
KCNH4Q9UQ05 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
KCNH4Q9UQ05 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
KCNH4Q9UQ05 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
KCNH4Q9UQ05 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
KCNH4Q9UQ05 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
KCNH4Q9UQ05 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
KCNH4Q9UQ05 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
KCNH4Q9UQ05 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
KCNH4Q9UQ05 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
KCNH4Q9UQ05 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
KCNH4Q9UQ05 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
KCNH4Q9UQ05 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
KCNH4Q9UQ05 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
KCNH4Q9UQ05 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
KCNH4Q9UQ05 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
KCNH4Q9UQ05 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
KCNH4Q9UQ05 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
KCNH4Q9UQ05 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
KCNH4Q9UQ05 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
KCNH4Q9UQ05 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
KCNH4Q9UQ05 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
KCNH4Q9UQ05 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
KCNH4Q9UQ05 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
KCNH4Q9UQ05 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
KCNH4Q9UQ05 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
KCNH4Q9UQ05 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
KCNH4Q9UQ05 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
KCNH4Q9UQ05 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
KCNH4Q9UQ05 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
KCNH4Q9UQ05 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
KCNH4Q9UQ05 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
KCNH4Q9UQ05 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
KCNH4Q9UQ05 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
KCNH4Q9UQ05 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
KCNH4Q9UQ05 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
KCNH4Q9UQ05 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
KCNH4Q9UQ05 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
KCNH4Q9UQ05 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
KCNH4Q9UQ05 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
KCNH4Q9UQ05 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
KCNH4Q9UQ05 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
KCNH4Q9UQ05 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
KCNH4Q9UQ05 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC23.36■■□□□ 1.33
KCNH4Q9UQ05 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
KCNH4Q9UQ05 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC23.36■■□□□ 1.33
KCNH4Q9UQ05 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
KCNH4Q9UQ05 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
KCNH4Q9UQ05 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
KCNH4Q9UQ05 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
KCNH4Q9UQ05 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
KCNH4Q9UQ05 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
KCNH4Q9UQ05 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
KCNH4Q9UQ05 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
KCNH4Q9UQ05 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
KCNH4Q9UQ05 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
KCNH4Q9UQ05 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
KCNH4Q9UQ05 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
KCNH4Q9UQ05 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
KCNH4Q9UQ05 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
KCNH4Q9UQ05 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
KCNH4Q9UQ05 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
KCNH4Q9UQ05 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
KCNH4Q9UQ05 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
KCNH4Q9UQ05 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
KCNH4Q9UQ05 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
KCNH4Q9UQ05 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
KCNH4Q9UQ05 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
KCNH4Q9UQ05 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
KCNH4Q9UQ05 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
KCNH4Q9UQ05 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
KCNH4Q9UQ05 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
KCNH4Q9UQ05 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
KCNH4Q9UQ05 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
KCNH4Q9UQ05 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
KCNH4Q9UQ05 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
KCNH4Q9UQ05 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
KCNH4Q9UQ05 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
KCNH4Q9UQ05 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
KCNH4Q9UQ05 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
KCNH4Q9UQ05 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
KCNH4Q9UQ05 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC23.34■■□□□ 1.33
KCNH4Q9UQ05 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
KCNH4Q9UQ05 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
KCNH4Q9UQ05 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.3 ms