Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPW5

AGTPBP1, Cytosolic carboxypeptidase 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,226 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AGTPBP1Q9UPW5 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
AGTPBP1Q9UPW5 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
AGTPBP1Q9UPW5 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
AGTPBP1Q9UPW5 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
AGTPBP1Q9UPW5 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
AGTPBP1Q9UPW5 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
AGTPBP1Q9UPW5 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
AGTPBP1Q9UPW5 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
AGTPBP1Q9UPW5 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
AGTPBP1Q9UPW5 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
AGTPBP1Q9UPW5 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
AGTPBP1Q9UPW5 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
AGTPBP1Q9UPW5 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
AGTPBP1Q9UPW5 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
AGTPBP1Q9UPW5 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
AGTPBP1Q9UPW5 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
AGTPBP1Q9UPW5 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
AGTPBP1Q9UPW5 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
AGTPBP1Q9UPW5 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
AGTPBP1Q9UPW5 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
AGTPBP1Q9UPW5 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
AGTPBP1Q9UPW5 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC23.39■■□□□ 1.33
AGTPBP1Q9UPW5 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
AGTPBP1Q9UPW5 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
AGTPBP1Q9UPW5 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
AGTPBP1Q9UPW5 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
AGTPBP1Q9UPW5 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
AGTPBP1Q9UPW5 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
AGTPBP1Q9UPW5 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
AGTPBP1Q9UPW5 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
AGTPBP1Q9UPW5 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
AGTPBP1Q9UPW5 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
AGTPBP1Q9UPW5 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
AGTPBP1Q9UPW5 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
AGTPBP1Q9UPW5 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
AGTPBP1Q9UPW5 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
AGTPBP1Q9UPW5 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
AGTPBP1Q9UPW5 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
AGTPBP1Q9UPW5 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
AGTPBP1Q9UPW5 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
AGTPBP1Q9UPW5 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
AGTPBP1Q9UPW5 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
AGTPBP1Q9UPW5 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
AGTPBP1Q9UPW5 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
AGTPBP1Q9UPW5 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
AGTPBP1Q9UPW5 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC23.38■■□□□ 1.33
AGTPBP1Q9UPW5 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
AGTPBP1Q9UPW5 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
AGTPBP1Q9UPW5 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
AGTPBP1Q9UPW5 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
AGTPBP1Q9UPW5 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
AGTPBP1Q9UPW5 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
AGTPBP1Q9UPW5 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
AGTPBP1Q9UPW5 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
AGTPBP1Q9UPW5 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
AGTPBP1Q9UPW5 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
AGTPBP1Q9UPW5 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
AGTPBP1Q9UPW5 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
AGTPBP1Q9UPW5 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
AGTPBP1Q9UPW5 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
AGTPBP1Q9UPW5 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
AGTPBP1Q9UPW5 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
AGTPBP1Q9UPW5 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
AGTPBP1Q9UPW5 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
AGTPBP1Q9UPW5 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
AGTPBP1Q9UPW5 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
AGTPBP1Q9UPW5 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
AGTPBP1Q9UPW5 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
AGTPBP1Q9UPW5 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
AGTPBP1Q9UPW5 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
AGTPBP1Q9UPW5 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
AGTPBP1Q9UPW5 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
AGTPBP1Q9UPW5 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
AGTPBP1Q9UPW5 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
AGTPBP1Q9UPW5 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
AGTPBP1Q9UPW5 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
AGTPBP1Q9UPW5 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
AGTPBP1Q9UPW5 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
AGTPBP1Q9UPW5 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
AGTPBP1Q9UPW5 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
AGTPBP1Q9UPW5 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
AGTPBP1Q9UPW5 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
AGTPBP1Q9UPW5 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
AGTPBP1Q9UPW5 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
AGTPBP1Q9UPW5 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
AGTPBP1Q9UPW5 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
AGTPBP1Q9UPW5 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
AGTPBP1Q9UPW5 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
AGTPBP1Q9UPW5 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
AGTPBP1Q9UPW5 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
AGTPBP1Q9UPW5 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
AGTPBP1Q9UPW5 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
AGTPBP1Q9UPW5 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
AGTPBP1Q9UPW5 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
AGTPBP1Q9UPW5 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
AGTPBP1Q9UPW5 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
AGTPBP1Q9UPW5 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
AGTPBP1Q9UPW5 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
AGTPBP1Q9UPW5 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
AGTPBP1Q9UPW5 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.8 ms