Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULV3

CIZ1, Cip1-interacting zinc finger protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 898 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CIZ1Q9ULV3 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
CIZ1Q9ULV3 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CIZ1Q9ULV3 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CIZ1Q9ULV3 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CIZ1Q9ULV3 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CIZ1Q9ULV3 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CIZ1Q9ULV3 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CIZ1Q9ULV3 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CIZ1Q9ULV3 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
CIZ1Q9ULV3 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
CIZ1Q9ULV3 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
CIZ1Q9ULV3 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC23.64■■□□□ 1.38
CIZ1Q9ULV3 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
CIZ1Q9ULV3 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CIZ1Q9ULV3 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CIZ1Q9ULV3 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CIZ1Q9ULV3 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
CIZ1Q9ULV3 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CIZ1Q9ULV3 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CIZ1Q9ULV3 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CIZ1Q9ULV3 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CIZ1Q9ULV3 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CIZ1Q9ULV3 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CIZ1Q9ULV3 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CIZ1Q9ULV3 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CIZ1Q9ULV3 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CIZ1Q9ULV3 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CIZ1Q9ULV3 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CIZ1Q9ULV3 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CIZ1Q9ULV3 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CIZ1Q9ULV3 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CIZ1Q9ULV3 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CIZ1Q9ULV3 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CIZ1Q9ULV3 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
CIZ1Q9ULV3 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CIZ1Q9ULV3 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CIZ1Q9ULV3 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CIZ1Q9ULV3 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CIZ1Q9ULV3 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CIZ1Q9ULV3 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CIZ1Q9ULV3 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
CIZ1Q9ULV3 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CIZ1Q9ULV3 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CIZ1Q9ULV3 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CIZ1Q9ULV3 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CIZ1Q9ULV3 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CIZ1Q9ULV3 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CIZ1Q9ULV3 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CIZ1Q9ULV3 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CIZ1Q9ULV3 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CIZ1Q9ULV3 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CIZ1Q9ULV3 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CIZ1Q9ULV3 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CIZ1Q9ULV3 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CIZ1Q9ULV3 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CIZ1Q9ULV3 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CIZ1Q9ULV3 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CIZ1Q9ULV3 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CIZ1Q9ULV3 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CIZ1Q9ULV3 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CIZ1Q9ULV3 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CIZ1Q9ULV3 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CIZ1Q9ULV3 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CIZ1Q9ULV3 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CIZ1Q9ULV3 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CIZ1Q9ULV3 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CIZ1Q9ULV3 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CIZ1Q9ULV3 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CIZ1Q9ULV3 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CIZ1Q9ULV3 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CIZ1Q9ULV3 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CIZ1Q9ULV3 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CIZ1Q9ULV3 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CIZ1Q9ULV3 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CIZ1Q9ULV3 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CIZ1Q9ULV3 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CIZ1Q9ULV3 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CIZ1Q9ULV3 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CIZ1Q9ULV3 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CIZ1Q9ULV3 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
CIZ1Q9ULV3 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CIZ1Q9ULV3 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CIZ1Q9ULV3 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CIZ1Q9ULV3 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CIZ1Q9ULV3 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CIZ1Q9ULV3 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CIZ1Q9ULV3 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CIZ1Q9ULV3 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CIZ1Q9ULV3 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CIZ1Q9ULV3 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CIZ1Q9ULV3 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CIZ1Q9ULV3 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CIZ1Q9ULV3 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CIZ1Q9ULV3 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CIZ1Q9ULV3 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CIZ1Q9ULV3 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CIZ1Q9ULV3 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CIZ1Q9ULV3 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CIZ1Q9ULV3 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CIZ1Q9ULV3 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.5 ms