Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKK3

PARP4, Poly [ADP-ribose] polymerase 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,724 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PARP4Q9UKK3 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
PARP4Q9UKK3 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC26.66■■□□□ 1.86
PARP4Q9UKK3 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC26.66■■□□□ 1.86
PARP4Q9UKK3 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
PARP4Q9UKK3 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
PARP4Q9UKK3 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
PARP4Q9UKK3 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
PARP4Q9UKK3 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
PARP4Q9UKK3 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
PARP4Q9UKK3 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
PARP4Q9UKK3 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.65■■□□□ 1.86
PARP4Q9UKK3 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
PARP4Q9UKK3 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
PARP4Q9UKK3 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
PARP4Q9UKK3 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
PARP4Q9UKK3 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
PARP4Q9UKK3 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
PARP4Q9UKK3 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
PARP4Q9UKK3 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
PARP4Q9UKK3 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.65■■□□□ 1.86
PARP4Q9UKK3 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
PARP4Q9UKK3 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
PARP4Q9UKK3 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC26.65■■□□□ 1.86
PARP4Q9UKK3 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
PARP4Q9UKK3 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
PARP4Q9UKK3 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
PARP4Q9UKK3 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
PARP4Q9UKK3 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
PARP4Q9UKK3 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
PARP4Q9UKK3 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
PARP4Q9UKK3 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC26.64■■□□□ 1.86
PARP4Q9UKK3 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
PARP4Q9UKK3 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
PARP4Q9UKK3 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
PARP4Q9UKK3 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.85
PARP4Q9UKK3 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC26.64■■□□□ 1.85
PARP4Q9UKK3 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.85
PARP4Q9UKK3 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.85
PARP4Q9UKK3 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC26.64■■□□□ 1.85
PARP4Q9UKK3 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC26.64■■□□□ 1.85
PARP4Q9UKK3 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
PARP4Q9UKK3 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
PARP4Q9UKK3 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC26.64■■□□□ 1.85
PARP4Q9UKK3 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
PARP4Q9UKK3 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
PARP4Q9UKK3 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
PARP4Q9UKK3 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
PARP4Q9UKK3 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
PARP4Q9UKK3 PDCD2L-203ENST00000587065 492 ntTSL 3 BASIC26.63■■□□□ 1.85
PARP4Q9UKK3 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC26.63■■□□□ 1.85
PARP4Q9UKK3 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
PARP4Q9UKK3 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
PARP4Q9UKK3 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
PARP4Q9UKK3 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
PARP4Q9UKK3 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
PARP4Q9UKK3 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
PARP4Q9UKK3 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
PARP4Q9UKK3 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
PARP4Q9UKK3 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
PARP4Q9UKK3 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
PARP4Q9UKK3 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
PARP4Q9UKK3 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
PARP4Q9UKK3 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
PARP4Q9UKK3 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
PARP4Q9UKK3 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
PARP4Q9UKK3 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
PARP4Q9UKK3 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC26.62■■□□□ 1.85
PARP4Q9UKK3 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
PARP4Q9UKK3 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
PARP4Q9UKK3 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
PARP4Q9UKK3 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC26.62■■□□□ 1.85
PARP4Q9UKK3 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
PARP4Q9UKK3 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
PARP4Q9UKK3 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
PARP4Q9UKK3 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC26.62■■□□□ 1.85
PARP4Q9UKK3 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
PARP4Q9UKK3 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
PARP4Q9UKK3 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
PARP4Q9UKK3 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
PARP4Q9UKK3 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
PARP4Q9UKK3 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
PARP4Q9UKK3 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC26.61■■□□□ 1.85
PARP4Q9UKK3 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
PARP4Q9UKK3 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
PARP4Q9UKK3 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
PARP4Q9UKK3 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
PARP4Q9UKK3 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
PARP4Q9UKK3 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
PARP4Q9UKK3 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
PARP4Q9UKK3 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
PARP4Q9UKK3 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
PARP4Q9UKK3 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
PARP4Q9UKK3 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
PARP4Q9UKK3 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
PARP4Q9UKK3 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
PARP4Q9UKK3 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
PARP4Q9UKK3 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
PARP4Q9UKK3 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
PARP4Q9UKK3 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
PARP4Q9UKK3 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC26.6■■□□□ 1.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.1 ms