Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKJ5

CHIC2, Cysteine-rich hydrophobic domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 165 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHIC2Q9UKJ5 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC30.36■■■□□ 2.45
CHIC2Q9UKJ5 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC30.36■■■□□ 2.45
CHIC2Q9UKJ5 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
CHIC2Q9UKJ5 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
CHIC2Q9UKJ5 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC30.35■■■□□ 2.45
CHIC2Q9UKJ5 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
CHIC2Q9UKJ5 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
CHIC2Q9UKJ5 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
CHIC2Q9UKJ5 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.35■■■□□ 2.45
CHIC2Q9UKJ5 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC30.35■■■□□ 2.45
CHIC2Q9UKJ5 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC30.35■■■□□ 2.45
CHIC2Q9UKJ5 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.35■■■□□ 2.45
CHIC2Q9UKJ5 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.35■■■□□ 2.45
CHIC2Q9UKJ5 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
CHIC2Q9UKJ5 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
CHIC2Q9UKJ5 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
CHIC2Q9UKJ5 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC30.34■■■□□ 2.45
CHIC2Q9UKJ5 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.34■■■□□ 2.45
CHIC2Q9UKJ5 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
CHIC2Q9UKJ5 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC30.34■■■□□ 2.45
CHIC2Q9UKJ5 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
CHIC2Q9UKJ5 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
CHIC2Q9UKJ5 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.34■■■□□ 2.45
CHIC2Q9UKJ5 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC30.34■■■□□ 2.45
CHIC2Q9UKJ5 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
CHIC2Q9UKJ5 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC30.33■■■□□ 2.45
CHIC2Q9UKJ5 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC30.33■■■□□ 2.45
CHIC2Q9UKJ5 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC30.33■■■□□ 2.45
CHIC2Q9UKJ5 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC30.33■■■□□ 2.45
CHIC2Q9UKJ5 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
CHIC2Q9UKJ5 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
CHIC2Q9UKJ5 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
CHIC2Q9UKJ5 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
CHIC2Q9UKJ5 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
CHIC2Q9UKJ5 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.33■■■□□ 2.45
CHIC2Q9UKJ5 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC30.33■■■□□ 2.45
CHIC2Q9UKJ5 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC30.33■■■□□ 2.45
CHIC2Q9UKJ5 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC30.33■■■□□ 2.45
CHIC2Q9UKJ5 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC30.33■■■□□ 2.45
CHIC2Q9UKJ5 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
CHIC2Q9UKJ5 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
CHIC2Q9UKJ5 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
CHIC2Q9UKJ5 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
CHIC2Q9UKJ5 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC30.32■■■□□ 2.44
CHIC2Q9UKJ5 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.32■■■□□ 2.44
CHIC2Q9UKJ5 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC30.32■■■□□ 2.44
CHIC2Q9UKJ5 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC30.32■■■□□ 2.44
CHIC2Q9UKJ5 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC30.32■■■□□ 2.44
CHIC2Q9UKJ5 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
CHIC2Q9UKJ5 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
CHIC2Q9UKJ5 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
CHIC2Q9UKJ5 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
CHIC2Q9UKJ5 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.31■■■□□ 2.44
CHIC2Q9UKJ5 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC30.31■■■□□ 2.44
CHIC2Q9UKJ5 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC30.31■■■□□ 2.44
CHIC2Q9UKJ5 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC30.31■■■□□ 2.44
CHIC2Q9UKJ5 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC30.31■■■□□ 2.44
CHIC2Q9UKJ5 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC30.31■■■□□ 2.44
CHIC2Q9UKJ5 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC30.31■■■□□ 2.44
CHIC2Q9UKJ5 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
CHIC2Q9UKJ5 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
CHIC2Q9UKJ5 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.31■■■□□ 2.44
CHIC2Q9UKJ5 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC30.3■■■□□ 2.44
CHIC2Q9UKJ5 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
CHIC2Q9UKJ5 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
CHIC2Q9UKJ5 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.3■■■□□ 2.44
CHIC2Q9UKJ5 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC30.3■■■□□ 2.44
CHIC2Q9UKJ5 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC30.3■■■□□ 2.44
CHIC2Q9UKJ5 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
CHIC2Q9UKJ5 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC30.3■■■□□ 2.44
CHIC2Q9UKJ5 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
CHIC2Q9UKJ5 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC30.29■■■□□ 2.44
CHIC2Q9UKJ5 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC30.29■■■□□ 2.44
CHIC2Q9UKJ5 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.29■■■□□ 2.44
CHIC2Q9UKJ5 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
CHIC2Q9UKJ5 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC30.29■■■□□ 2.44
CHIC2Q9UKJ5 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.29■■■□□ 2.44
CHIC2Q9UKJ5 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC30.29■■■□□ 2.44
CHIC2Q9UKJ5 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC30.29■■■□□ 2.44
CHIC2Q9UKJ5 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
CHIC2Q9UKJ5 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
CHIC2Q9UKJ5 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
CHIC2Q9UKJ5 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
CHIC2Q9UKJ5 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.28■■■□□ 2.44
CHIC2Q9UKJ5 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC30.28■■■□□ 2.44
CHIC2Q9UKJ5 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
CHIC2Q9UKJ5 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
CHIC2Q9UKJ5 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
CHIC2Q9UKJ5 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
CHIC2Q9UKJ5 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.28■■■□□ 2.44
CHIC2Q9UKJ5 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC30.28■■■□□ 2.44
CHIC2Q9UKJ5 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC30.28■■■□□ 2.44
CHIC2Q9UKJ5 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
CHIC2Q9UKJ5 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC30.28■■■□□ 2.44
CHIC2Q9UKJ5 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC30.28■■■□□ 2.44
CHIC2Q9UKJ5 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
CHIC2Q9UKJ5 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
CHIC2Q9UKJ5 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
CHIC2Q9UKJ5 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
CHIC2Q9UKJ5 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.3 ms