Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJT2

TSKS, Testis-specific serine kinase substrate, humanhuman

Predictions only

Length 592 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSKSQ9UJT2 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
TSKSQ9UJT2 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
TSKSQ9UJT2 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
TSKSQ9UJT2 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
TSKSQ9UJT2 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
TSKSQ9UJT2 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
TSKSQ9UJT2 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
TSKSQ9UJT2 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
TSKSQ9UJT2 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TSKSQ9UJT2 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TSKSQ9UJT2 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
TSKSQ9UJT2 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TSKSQ9UJT2 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TSKSQ9UJT2 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TSKSQ9UJT2 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TSKSQ9UJT2 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TSKSQ9UJT2 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TSKSQ9UJT2 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TSKSQ9UJT2 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TSKSQ9UJT2 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
TSKSQ9UJT2 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
TSKSQ9UJT2 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC23.71■■□□□ 1.39
TSKSQ9UJT2 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
TSKSQ9UJT2 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
TSKSQ9UJT2 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TSKSQ9UJT2 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.39
TSKSQ9UJT2 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
TSKSQ9UJT2 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
TSKSQ9UJT2 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
TSKSQ9UJT2 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
TSKSQ9UJT2 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
TSKSQ9UJT2 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
TSKSQ9UJT2 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
TSKSQ9UJT2 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
TSKSQ9UJT2 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.38
TSKSQ9UJT2 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
TSKSQ9UJT2 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
TSKSQ9UJT2 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
TSKSQ9UJT2 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
TSKSQ9UJT2 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
TSKSQ9UJT2 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
TSKSQ9UJT2 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
TSKSQ9UJT2 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
TSKSQ9UJT2 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TSKSQ9UJT2 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
TSKSQ9UJT2 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TSKSQ9UJT2 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
TSKSQ9UJT2 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TSKSQ9UJT2 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TSKSQ9UJT2 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
TSKSQ9UJT2 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
TSKSQ9UJT2 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TSKSQ9UJT2 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TSKSQ9UJT2 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
TSKSQ9UJT2 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TSKSQ9UJT2 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TSKSQ9UJT2 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TSKSQ9UJT2 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TSKSQ9UJT2 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TSKSQ9UJT2 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
TSKSQ9UJT2 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TSKSQ9UJT2 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
TSKSQ9UJT2 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TSKSQ9UJT2 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TSKSQ9UJT2 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TSKSQ9UJT2 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
TSKSQ9UJT2 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
TSKSQ9UJT2 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TSKSQ9UJT2 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
TSKSQ9UJT2 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
TSKSQ9UJT2 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TSKSQ9UJT2 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
TSKSQ9UJT2 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TSKSQ9UJT2 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
TSKSQ9UJT2 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
TSKSQ9UJT2 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC23.68■■□□□ 1.38
TSKSQ9UJT2 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
TSKSQ9UJT2 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC23.68■■□□□ 1.38
TSKSQ9UJT2 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
TSKSQ9UJT2 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TSKSQ9UJT2 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
TSKSQ9UJT2 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
TSKSQ9UJT2 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
TSKSQ9UJT2 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TSKSQ9UJT2 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
TSKSQ9UJT2 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TSKSQ9UJT2 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TSKSQ9UJT2 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
TSKSQ9UJT2 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
TSKSQ9UJT2 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TSKSQ9UJT2 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
TSKSQ9UJT2 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
TSKSQ9UJT2 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TSKSQ9UJT2 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
TSKSQ9UJT2 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
TSKSQ9UJT2 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
TSKSQ9UJT2 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TSKSQ9UJT2 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TSKSQ9UJT2 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
TSKSQ9UJT2 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27 ms