Protein–RNA interactions for Protein: Q9UIW0

VAX2, Ventral anterior homeobox 2, humanhuman

Predictions only

Length 290 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAX2Q9UIW0 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
VAX2Q9UIW0 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
VAX2Q9UIW0 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
VAX2Q9UIW0 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
VAX2Q9UIW0 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
VAX2Q9UIW0 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
VAX2Q9UIW0 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
VAX2Q9UIW0 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
VAX2Q9UIW0 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
VAX2Q9UIW0 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
VAX2Q9UIW0 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
VAX2Q9UIW0 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
VAX2Q9UIW0 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
VAX2Q9UIW0 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
VAX2Q9UIW0 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
VAX2Q9UIW0 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
VAX2Q9UIW0 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
VAX2Q9UIW0 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
VAX2Q9UIW0 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
VAX2Q9UIW0 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
VAX2Q9UIW0 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
VAX2Q9UIW0 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
VAX2Q9UIW0 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
VAX2Q9UIW0 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
VAX2Q9UIW0 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
VAX2Q9UIW0 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
VAX2Q9UIW0 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
VAX2Q9UIW0 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
VAX2Q9UIW0 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
VAX2Q9UIW0 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
VAX2Q9UIW0 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
VAX2Q9UIW0 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
VAX2Q9UIW0 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
VAX2Q9UIW0 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
VAX2Q9UIW0 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
VAX2Q9UIW0 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
VAX2Q9UIW0 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
VAX2Q9UIW0 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
VAX2Q9UIW0 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
VAX2Q9UIW0 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
VAX2Q9UIW0 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
VAX2Q9UIW0 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
VAX2Q9UIW0 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
VAX2Q9UIW0 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
VAX2Q9UIW0 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
VAX2Q9UIW0 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
VAX2Q9UIW0 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
VAX2Q9UIW0 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
VAX2Q9UIW0 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
VAX2Q9UIW0 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
VAX2Q9UIW0 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
VAX2Q9UIW0 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
VAX2Q9UIW0 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
VAX2Q9UIW0 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
VAX2Q9UIW0 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
VAX2Q9UIW0 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
VAX2Q9UIW0 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
VAX2Q9UIW0 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
VAX2Q9UIW0 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
VAX2Q9UIW0 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
VAX2Q9UIW0 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
VAX2Q9UIW0 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
VAX2Q9UIW0 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
VAX2Q9UIW0 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.76■□□□□ 0.11
VAX2Q9UIW0 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
VAX2Q9UIW0 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
VAX2Q9UIW0 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
VAX2Q9UIW0 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
VAX2Q9UIW0 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
VAX2Q9UIW0 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
VAX2Q9UIW0 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
VAX2Q9UIW0 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
VAX2Q9UIW0 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
VAX2Q9UIW0 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
VAX2Q9UIW0 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
VAX2Q9UIW0 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
VAX2Q9UIW0 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
VAX2Q9UIW0 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
VAX2Q9UIW0 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
VAX2Q9UIW0 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
VAX2Q9UIW0 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
VAX2Q9UIW0 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
VAX2Q9UIW0 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
VAX2Q9UIW0 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
VAX2Q9UIW0 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
VAX2Q9UIW0 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
VAX2Q9UIW0 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
VAX2Q9UIW0 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
VAX2Q9UIW0 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
VAX2Q9UIW0 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
VAX2Q9UIW0 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
VAX2Q9UIW0 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
VAX2Q9UIW0 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
VAX2Q9UIW0 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
VAX2Q9UIW0 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
VAX2Q9UIW0 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
VAX2Q9UIW0 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
VAX2Q9UIW0 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
VAX2Q9UIW0 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
VAX2Q9UIW0 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25 ms