Protein–RNA interactions for Protein: Q9UDY4

DNAJB4, DnaJ homolog subfamily B member 4, humanhuman

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Length 337 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNAJB4Q9UDY4 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
DNAJB4Q9UDY4 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
DNAJB4Q9UDY4 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
DNAJB4Q9UDY4 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
DNAJB4Q9UDY4 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
DNAJB4Q9UDY4 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
DNAJB4Q9UDY4 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC21.74■■□□□ 1.07
DNAJB4Q9UDY4 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
DNAJB4Q9UDY4 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
DNAJB4Q9UDY4 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
DNAJB4Q9UDY4 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
DNAJB4Q9UDY4 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
DNAJB4Q9UDY4 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
DNAJB4Q9UDY4 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
DNAJB4Q9UDY4 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
DNAJB4Q9UDY4 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
DNAJB4Q9UDY4 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
DNAJB4Q9UDY4 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
DNAJB4Q9UDY4 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
DNAJB4Q9UDY4 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
DNAJB4Q9UDY4 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
DNAJB4Q9UDY4 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
DNAJB4Q9UDY4 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
DNAJB4Q9UDY4 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
DNAJB4Q9UDY4 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
DNAJB4Q9UDY4 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
DNAJB4Q9UDY4 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC21.73■■□□□ 1.07
DNAJB4Q9UDY4 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
DNAJB4Q9UDY4 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
DNAJB4Q9UDY4 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
DNAJB4Q9UDY4 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
DNAJB4Q9UDY4 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
DNAJB4Q9UDY4 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
DNAJB4Q9UDY4 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
DNAJB4Q9UDY4 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
DNAJB4Q9UDY4 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
DNAJB4Q9UDY4 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
DNAJB4Q9UDY4 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
DNAJB4Q9UDY4 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
DNAJB4Q9UDY4 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
DNAJB4Q9UDY4 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
DNAJB4Q9UDY4 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
DNAJB4Q9UDY4 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
DNAJB4Q9UDY4 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC21.72■■□□□ 1.07
DNAJB4Q9UDY4 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
DNAJB4Q9UDY4 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
DNAJB4Q9UDY4 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
DNAJB4Q9UDY4 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
DNAJB4Q9UDY4 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
DNAJB4Q9UDY4 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
DNAJB4Q9UDY4 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
DNAJB4Q9UDY4 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
DNAJB4Q9UDY4 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
DNAJB4Q9UDY4 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
DNAJB4Q9UDY4 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
DNAJB4Q9UDY4 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
DNAJB4Q9UDY4 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
DNAJB4Q9UDY4 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
DNAJB4Q9UDY4 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
DNAJB4Q9UDY4 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
DNAJB4Q9UDY4 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
DNAJB4Q9UDY4 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
DNAJB4Q9UDY4 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
DNAJB4Q9UDY4 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
DNAJB4Q9UDY4 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
DNAJB4Q9UDY4 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
DNAJB4Q9UDY4 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
DNAJB4Q9UDY4 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
DNAJB4Q9UDY4 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
DNAJB4Q9UDY4 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
DNAJB4Q9UDY4 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
DNAJB4Q9UDY4 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
DNAJB4Q9UDY4 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
DNAJB4Q9UDY4 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
DNAJB4Q9UDY4 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
DNAJB4Q9UDY4 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
DNAJB4Q9UDY4 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
DNAJB4Q9UDY4 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
DNAJB4Q9UDY4 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
DNAJB4Q9UDY4 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
DNAJB4Q9UDY4 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
DNAJB4Q9UDY4 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
DNAJB4Q9UDY4 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
DNAJB4Q9UDY4 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
DNAJB4Q9UDY4 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
DNAJB4Q9UDY4 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
DNAJB4Q9UDY4 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
DNAJB4Q9UDY4 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
DNAJB4Q9UDY4 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
DNAJB4Q9UDY4 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
DNAJB4Q9UDY4 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
DNAJB4Q9UDY4 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
DNAJB4Q9UDY4 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
DNAJB4Q9UDY4 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
DNAJB4Q9UDY4 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
DNAJB4Q9UDY4 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
DNAJB4Q9UDY4 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
DNAJB4Q9UDY4 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
DNAJB4Q9UDY4 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
DNAJB4Q9UDY4 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
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