Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBT7

CTNNAL1, Alpha-catulin, humanhuman

Predictions only

Length 734 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNNAL1Q9UBT7 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CTNNAL1Q9UBT7 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CTNNAL1Q9UBT7 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CTNNAL1Q9UBT7 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CTNNAL1Q9UBT7 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CTNNAL1Q9UBT7 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CTNNAL1Q9UBT7 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CTNNAL1Q9UBT7 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CTNNAL1Q9UBT7 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CTNNAL1Q9UBT7 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CTNNAL1Q9UBT7 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CTNNAL1Q9UBT7 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CTNNAL1Q9UBT7 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CTNNAL1Q9UBT7 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CTNNAL1Q9UBT7 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CTNNAL1Q9UBT7 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CTNNAL1Q9UBT7 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CTNNAL1Q9UBT7 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CTNNAL1Q9UBT7 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CTNNAL1Q9UBT7 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CTNNAL1Q9UBT7 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CTNNAL1Q9UBT7 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
CTNNAL1Q9UBT7 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CTNNAL1Q9UBT7 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CTNNAL1Q9UBT7 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CTNNAL1Q9UBT7 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CTNNAL1Q9UBT7 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CTNNAL1Q9UBT7 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CTNNAL1Q9UBT7 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
CTNNAL1Q9UBT7 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CTNNAL1Q9UBT7 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CTNNAL1Q9UBT7 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CTNNAL1Q9UBT7 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CTNNAL1Q9UBT7 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CTNNAL1Q9UBT7 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CTNNAL1Q9UBT7 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CTNNAL1Q9UBT7 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CTNNAL1Q9UBT7 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CTNNAL1Q9UBT7 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CTNNAL1Q9UBT7 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CTNNAL1Q9UBT7 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CTNNAL1Q9UBT7 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CTNNAL1Q9UBT7 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CTNNAL1Q9UBT7 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CTNNAL1Q9UBT7 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CTNNAL1Q9UBT7 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CTNNAL1Q9UBT7 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CTNNAL1Q9UBT7 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CTNNAL1Q9UBT7 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CTNNAL1Q9UBT7 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
CTNNAL1Q9UBT7 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CTNNAL1Q9UBT7 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CTNNAL1Q9UBT7 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CTNNAL1Q9UBT7 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CTNNAL1Q9UBT7 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CTNNAL1Q9UBT7 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
CTNNAL1Q9UBT7 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CTNNAL1Q9UBT7 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CTNNAL1Q9UBT7 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CTNNAL1Q9UBT7 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CTNNAL1Q9UBT7 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CTNNAL1Q9UBT7 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CTNNAL1Q9UBT7 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CTNNAL1Q9UBT7 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
CTNNAL1Q9UBT7 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CTNNAL1Q9UBT7 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CTNNAL1Q9UBT7 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CTNNAL1Q9UBT7 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CTNNAL1Q9UBT7 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
CTNNAL1Q9UBT7 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CTNNAL1Q9UBT7 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CTNNAL1Q9UBT7 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CTNNAL1Q9UBT7 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CTNNAL1Q9UBT7 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CTNNAL1Q9UBT7 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CTNNAL1Q9UBT7 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CTNNAL1Q9UBT7 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CTNNAL1Q9UBT7 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CTNNAL1Q9UBT7 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CTNNAL1Q9UBT7 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CTNNAL1Q9UBT7 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CTNNAL1Q9UBT7 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CTNNAL1Q9UBT7 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
CTNNAL1Q9UBT7 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CTNNAL1Q9UBT7 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CTNNAL1Q9UBT7 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CTNNAL1Q9UBT7 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CTNNAL1Q9UBT7 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CTNNAL1Q9UBT7 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CTNNAL1Q9UBT7 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CTNNAL1Q9UBT7 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CTNNAL1Q9UBT7 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CTNNAL1Q9UBT7 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CTNNAL1Q9UBT7 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
CTNNAL1Q9UBT7 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CTNNAL1Q9UBT7 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CTNNAL1Q9UBT7 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CTNNAL1Q9UBT7 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CTNNAL1Q9UBT7 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CTNNAL1Q9UBT7 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.5 ms