Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2E5

CHPF2, Chondroitin sulfate glucuronyltransferase, humanhuman

Predictions only

Length 772 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHPF2Q9P2E5 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
CHPF2Q9P2E5 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CHPF2Q9P2E5 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CHPF2Q9P2E5 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CHPF2Q9P2E5 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CHPF2Q9P2E5 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CHPF2Q9P2E5 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CHPF2Q9P2E5 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CHPF2Q9P2E5 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
CHPF2Q9P2E5 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CHPF2Q9P2E5 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CHPF2Q9P2E5 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CHPF2Q9P2E5 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CHPF2Q9P2E5 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CHPF2Q9P2E5 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CHPF2Q9P2E5 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CHPF2Q9P2E5 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CHPF2Q9P2E5 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CHPF2Q9P2E5 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CHPF2Q9P2E5 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CHPF2Q9P2E5 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CHPF2Q9P2E5 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CHPF2Q9P2E5 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CHPF2Q9P2E5 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CHPF2Q9P2E5 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CHPF2Q9P2E5 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CHPF2Q9P2E5 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CHPF2Q9P2E5 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CHPF2Q9P2E5 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
CHPF2Q9P2E5 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
CHPF2Q9P2E5 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.71
CHPF2Q9P2E5 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
CHPF2Q9P2E5 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
CHPF2Q9P2E5 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
CHPF2Q9P2E5 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
CHPF2Q9P2E5 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
CHPF2Q9P2E5 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
CHPF2Q9P2E5 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
CHPF2Q9P2E5 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.7■■□□□ 1.7
CHPF2Q9P2E5 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
CHPF2Q9P2E5 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
CHPF2Q9P2E5 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC25.7■■□□□ 1.7
CHPF2Q9P2E5 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
CHPF2Q9P2E5 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
CHPF2Q9P2E5 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
CHPF2Q9P2E5 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
CHPF2Q9P2E5 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
CHPF2Q9P2E5 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
CHPF2Q9P2E5 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
CHPF2Q9P2E5 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
CHPF2Q9P2E5 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
CHPF2Q9P2E5 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CHPF2Q9P2E5 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CHPF2Q9P2E5 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CHPF2Q9P2E5 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CHPF2Q9P2E5 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CHPF2Q9P2E5 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CHPF2Q9P2E5 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CHPF2Q9P2E5 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CHPF2Q9P2E5 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CHPF2Q9P2E5 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CHPF2Q9P2E5 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CHPF2Q9P2E5 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CHPF2Q9P2E5 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
CHPF2Q9P2E5 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CHPF2Q9P2E5 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CHPF2Q9P2E5 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CHPF2Q9P2E5 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CHPF2Q9P2E5 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CHPF2Q9P2E5 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CHPF2Q9P2E5 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CHPF2Q9P2E5 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CHPF2Q9P2E5 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CHPF2Q9P2E5 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CHPF2Q9P2E5 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CHPF2Q9P2E5 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CHPF2Q9P2E5 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CHPF2Q9P2E5 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC25.67■■□□□ 1.7
CHPF2Q9P2E5 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
CHPF2Q9P2E5 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CHPF2Q9P2E5 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
CHPF2Q9P2E5 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
CHPF2Q9P2E5 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
CHPF2Q9P2E5 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
CHPF2Q9P2E5 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CHPF2Q9P2E5 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CHPF2Q9P2E5 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CHPF2Q9P2E5 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
CHPF2Q9P2E5 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CHPF2Q9P2E5 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
CHPF2Q9P2E5 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CHPF2Q9P2E5 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
CHPF2Q9P2E5 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CHPF2Q9P2E5 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CHPF2Q9P2E5 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CHPF2Q9P2E5 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
CHPF2Q9P2E5 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
CHPF2Q9P2E5 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
CHPF2Q9P2E5 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CHPF2Q9P2E5 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.2 ms