Protein–RNA interactions for Protein: Q9P232

CNTN3, Contactin-3, humanhuman

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Length 1,028 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTN3Q9P232 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CNTN3Q9P232 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CNTN3Q9P232 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CNTN3Q9P232 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CNTN3Q9P232 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CNTN3Q9P232 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
CNTN3Q9P232 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CNTN3Q9P232 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CNTN3Q9P232 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CNTN3Q9P232 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CNTN3Q9P232 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CNTN3Q9P232 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CNTN3Q9P232 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CNTN3Q9P232 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CNTN3Q9P232 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CNTN3Q9P232 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CNTN3Q9P232 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CNTN3Q9P232 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CNTN3Q9P232 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CNTN3Q9P232 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CNTN3Q9P232 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CNTN3Q9P232 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CNTN3Q9P232 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
CNTN3Q9P232 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CNTN3Q9P232 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CNTN3Q9P232 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CNTN3Q9P232 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CNTN3Q9P232 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CNTN3Q9P232 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CNTN3Q9P232 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CNTN3Q9P232 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CNTN3Q9P232 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CNTN3Q9P232 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CNTN3Q9P232 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CNTN3Q9P232 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CNTN3Q9P232 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CNTN3Q9P232 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CNTN3Q9P232 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CNTN3Q9P232 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CNTN3Q9P232 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CNTN3Q9P232 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CNTN3Q9P232 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
CNTN3Q9P232 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CNTN3Q9P232 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
CNTN3Q9P232 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CNTN3Q9P232 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CNTN3Q9P232 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CNTN3Q9P232 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CNTN3Q9P232 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CNTN3Q9P232 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CNTN3Q9P232 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CNTN3Q9P232 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CNTN3Q9P232 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CNTN3Q9P232 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CNTN3Q9P232 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CNTN3Q9P232 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CNTN3Q9P232 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CNTN3Q9P232 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CNTN3Q9P232 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CNTN3Q9P232 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CNTN3Q9P232 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CNTN3Q9P232 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CNTN3Q9P232 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CNTN3Q9P232 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CNTN3Q9P232 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CNTN3Q9P232 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CNTN3Q9P232 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CNTN3Q9P232 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CNTN3Q9P232 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CNTN3Q9P232 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CNTN3Q9P232 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CNTN3Q9P232 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CNTN3Q9P232 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CNTN3Q9P232 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CNTN3Q9P232 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CNTN3Q9P232 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CNTN3Q9P232 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CNTN3Q9P232 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CNTN3Q9P232 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CNTN3Q9P232 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CNTN3Q9P232 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CNTN3Q9P232 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CNTN3Q9P232 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CNTN3Q9P232 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CNTN3Q9P232 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CNTN3Q9P232 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CNTN3Q9P232 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CNTN3Q9P232 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CNTN3Q9P232 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CNTN3Q9P232 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CNTN3Q9P232 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CNTN3Q9P232 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CNTN3Q9P232 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CNTN3Q9P232 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
CNTN3Q9P232 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CNTN3Q9P232 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CNTN3Q9P232 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
CNTN3Q9P232 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CNTN3Q9P232 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CNTN3Q9P232 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
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