Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0W2

HMG20B, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily E member 1-related, humanhuman

Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMG20BQ9P0W2 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
HMG20BQ9P0W2 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
HMG20BQ9P0W2 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
HMG20BQ9P0W2 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
HMG20BQ9P0W2 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
HMG20BQ9P0W2 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
HMG20BQ9P0W2 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
HMG20BQ9P0W2 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
HMG20BQ9P0W2 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
HMG20BQ9P0W2 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
HMG20BQ9P0W2 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
HMG20BQ9P0W2 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
HMG20BQ9P0W2 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
HMG20BQ9P0W2 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
HMG20BQ9P0W2 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
HMG20BQ9P0W2 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
HMG20BQ9P0W2 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
HMG20BQ9P0W2 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
HMG20BQ9P0W2 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
HMG20BQ9P0W2 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
HMG20BQ9P0W2 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
HMG20BQ9P0W2 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
HMG20BQ9P0W2 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
HMG20BQ9P0W2 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
HMG20BQ9P0W2 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
HMG20BQ9P0W2 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
HMG20BQ9P0W2 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
HMG20BQ9P0W2 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
HMG20BQ9P0W2 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
HMG20BQ9P0W2 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC24.58■■□□□ 1.53
HMG20BQ9P0W2 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
HMG20BQ9P0W2 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
HMG20BQ9P0W2 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
HMG20BQ9P0W2 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
HMG20BQ9P0W2 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
HMG20BQ9P0W2 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
HMG20BQ9P0W2 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
HMG20BQ9P0W2 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
HMG20BQ9P0W2 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
HMG20BQ9P0W2 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
HMG20BQ9P0W2 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
HMG20BQ9P0W2 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
HMG20BQ9P0W2 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
HMG20BQ9P0W2 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
HMG20BQ9P0W2 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
HMG20BQ9P0W2 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
HMG20BQ9P0W2 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
HMG20BQ9P0W2 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
HMG20BQ9P0W2 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
HMG20BQ9P0W2 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
HMG20BQ9P0W2 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
HMG20BQ9P0W2 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
HMG20BQ9P0W2 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
HMG20BQ9P0W2 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
HMG20BQ9P0W2 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
HMG20BQ9P0W2 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
HMG20BQ9P0W2 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
HMG20BQ9P0W2 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
HMG20BQ9P0W2 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
HMG20BQ9P0W2 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
HMG20BQ9P0W2 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
HMG20BQ9P0W2 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
HMG20BQ9P0W2 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
HMG20BQ9P0W2 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
HMG20BQ9P0W2 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
HMG20BQ9P0W2 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC24.56■■□□□ 1.52
HMG20BQ9P0W2 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
HMG20BQ9P0W2 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
HMG20BQ9P0W2 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
HMG20BQ9P0W2 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
HMG20BQ9P0W2 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
HMG20BQ9P0W2 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
HMG20BQ9P0W2 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
HMG20BQ9P0W2 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
HMG20BQ9P0W2 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
HMG20BQ9P0W2 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
HMG20BQ9P0W2 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
HMG20BQ9P0W2 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
HMG20BQ9P0W2 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
HMG20BQ9P0W2 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
HMG20BQ9P0W2 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
HMG20BQ9P0W2 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
HMG20BQ9P0W2 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
HMG20BQ9P0W2 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
HMG20BQ9P0W2 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
HMG20BQ9P0W2 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
HMG20BQ9P0W2 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
HMG20BQ9P0W2 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
HMG20BQ9P0W2 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
HMG20BQ9P0W2 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
HMG20BQ9P0W2 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
HMG20BQ9P0W2 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
HMG20BQ9P0W2 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
HMG20BQ9P0W2 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
HMG20BQ9P0W2 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
HMG20BQ9P0W2 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
HMG20BQ9P0W2 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
HMG20BQ9P0W2 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
HMG20BQ9P0W2 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
HMG20BQ9P0W2 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.1 ms