Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSQ0

RRP7BP, Putative ribosomal RNA-processing protein 7 homolog B, humanhuman

Predictions only

Length 103 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RRP7BPQ9NSQ0 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
RRP7BPQ9NSQ0 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
RRP7BPQ9NSQ0 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.34■■■□□ 2.45
RRP7BPQ9NSQ0 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC30.34■■■□□ 2.45
RRP7BPQ9NSQ0 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC30.34■■■□□ 2.45
RRP7BPQ9NSQ0 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
RRP7BPQ9NSQ0 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
RRP7BPQ9NSQ0 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
RRP7BPQ9NSQ0 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC30.33■■■□□ 2.45
RRP7BPQ9NSQ0 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
RRP7BPQ9NSQ0 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
RRP7BPQ9NSQ0 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
RRP7BPQ9NSQ0 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
RRP7BPQ9NSQ0 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.33■■■□□ 2.45
RRP7BPQ9NSQ0 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC30.33■■■□□ 2.45
RRP7BPQ9NSQ0 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
RRP7BPQ9NSQ0 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC30.33■■■□□ 2.45
RRP7BPQ9NSQ0 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
RRP7BPQ9NSQ0 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
RRP7BPQ9NSQ0 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC30.33■■■□□ 2.45
RRP7BPQ9NSQ0 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
RRP7BPQ9NSQ0 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC30.32■■■□□ 2.44
RRP7BPQ9NSQ0 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
RRP7BPQ9NSQ0 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
RRP7BPQ9NSQ0 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.32■■■□□ 2.44
RRP7BPQ9NSQ0 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC30.32■■■□□ 2.44
RRP7BPQ9NSQ0 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC30.32■■■□□ 2.44
RRP7BPQ9NSQ0 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC30.32■■■□□ 2.44
RRP7BPQ9NSQ0 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC30.31■■■□□ 2.44
RRP7BPQ9NSQ0 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
RRP7BPQ9NSQ0 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
RRP7BPQ9NSQ0 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC30.31■■■□□ 2.44
RRP7BPQ9NSQ0 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC30.31■■■□□ 2.44
RRP7BPQ9NSQ0 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC30.31■■■□□ 2.44
RRP7BPQ9NSQ0 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC30.31■■■□□ 2.44
RRP7BPQ9NSQ0 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
RRP7BPQ9NSQ0 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
RRP7BPQ9NSQ0 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.31■■■□□ 2.44
RRP7BPQ9NSQ0 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
RRP7BPQ9NSQ0 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
RRP7BPQ9NSQ0 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC30.3■■■□□ 2.44
RRP7BPQ9NSQ0 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
RRP7BPQ9NSQ0 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC30.3■■■□□ 2.44
RRP7BPQ9NSQ0 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
RRP7BPQ9NSQ0 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
RRP7BPQ9NSQ0 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
RRP7BPQ9NSQ0 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC30.3■■■□□ 2.44
RRP7BPQ9NSQ0 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
RRP7BPQ9NSQ0 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC30.3■■■□□ 2.44
RRP7BPQ9NSQ0 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
RRP7BPQ9NSQ0 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
RRP7BPQ9NSQ0 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
RRP7BPQ9NSQ0 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
RRP7BPQ9NSQ0 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
RRP7BPQ9NSQ0 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC30.29■■■□□ 2.44
RRP7BPQ9NSQ0 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
RRP7BPQ9NSQ0 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
RRP7BPQ9NSQ0 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC30.29■■■□□ 2.44
RRP7BPQ9NSQ0 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC30.29■■■□□ 2.44
RRP7BPQ9NSQ0 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
RRP7BPQ9NSQ0 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.29■■■□□ 2.44
RRP7BPQ9NSQ0 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC30.29■■■□□ 2.44
RRP7BPQ9NSQ0 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
RRP7BPQ9NSQ0 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC30.29■■■□□ 2.44
RRP7BPQ9NSQ0 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
RRP7BPQ9NSQ0 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
RRP7BPQ9NSQ0 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
RRP7BPQ9NSQ0 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC30.28■■■□□ 2.44
RRP7BPQ9NSQ0 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
RRP7BPQ9NSQ0 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
RRP7BPQ9NSQ0 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC30.28■■■□□ 2.44
RRP7BPQ9NSQ0 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
RRP7BPQ9NSQ0 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
RRP7BPQ9NSQ0 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.28■■■□□ 2.44
RRP7BPQ9NSQ0 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC30.28■■■□□ 2.44
RRP7BPQ9NSQ0 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC30.28■■■□□ 2.44
RRP7BPQ9NSQ0 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC30.28■■■□□ 2.44
RRP7BPQ9NSQ0 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.28■■■□□ 2.44
RRP7BPQ9NSQ0 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC30.28■■■□□ 2.44
RRP7BPQ9NSQ0 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
RRP7BPQ9NSQ0 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
RRP7BPQ9NSQ0 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC30.28■■■□□ 2.44
RRP7BPQ9NSQ0 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC30.27■■■□□ 2.44
RRP7BPQ9NSQ0 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC30.27■■■□□ 2.44
RRP7BPQ9NSQ0 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC30.27■■■□□ 2.44
RRP7BPQ9NSQ0 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
RRP7BPQ9NSQ0 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
RRP7BPQ9NSQ0 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC30.27■■■□□ 2.44
RRP7BPQ9NSQ0 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
RRP7BPQ9NSQ0 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC30.27■■■□□ 2.44
RRP7BPQ9NSQ0 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC30.27■■■□□ 2.44
RRP7BPQ9NSQ0 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
RRP7BPQ9NSQ0 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
RRP7BPQ9NSQ0 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
RRP7BPQ9NSQ0 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
RRP7BPQ9NSQ0 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
RRP7BPQ9NSQ0 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
RRP7BPQ9NSQ0 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.44
RRP7BPQ9NSQ0 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC30.26■■■□□ 2.44
RRP7BPQ9NSQ0 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.5 ms