Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSD4

ZNF275, Zinc finger protein 275, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 429 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF275Q9NSD4 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
ZNF275Q9NSD4 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
ZNF275Q9NSD4 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
ZNF275Q9NSD4 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
ZNF275Q9NSD4 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
ZNF275Q9NSD4 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
ZNF275Q9NSD4 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
ZNF275Q9NSD4 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
ZNF275Q9NSD4 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ZNF275Q9NSD4 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
ZNF275Q9NSD4 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ZNF275Q9NSD4 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ZNF275Q9NSD4 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ZNF275Q9NSD4 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ZNF275Q9NSD4 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ZNF275Q9NSD4 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ZNF275Q9NSD4 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ZNF275Q9NSD4 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ZNF275Q9NSD4 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ZNF275Q9NSD4 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ZNF275Q9NSD4 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ZNF275Q9NSD4 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ZNF275Q9NSD4 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ZNF275Q9NSD4 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ZNF275Q9NSD4 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ZNF275Q9NSD4 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ZNF275Q9NSD4 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ZNF275Q9NSD4 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ZNF275Q9NSD4 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ZNF275Q9NSD4 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ZNF275Q9NSD4 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ZNF275Q9NSD4 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
ZNF275Q9NSD4 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ZNF275Q9NSD4 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ZNF275Q9NSD4 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ZNF275Q9NSD4 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ZNF275Q9NSD4 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ZNF275Q9NSD4 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ZNF275Q9NSD4 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ZNF275Q9NSD4 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ZNF275Q9NSD4 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ZNF275Q9NSD4 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ZNF275Q9NSD4 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ZNF275Q9NSD4 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ZNF275Q9NSD4 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ZNF275Q9NSD4 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ZNF275Q9NSD4 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ZNF275Q9NSD4 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ZNF275Q9NSD4 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ZNF275Q9NSD4 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ZNF275Q9NSD4 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ZNF275Q9NSD4 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ZNF275Q9NSD4 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ZNF275Q9NSD4 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ZNF275Q9NSD4 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ZNF275Q9NSD4 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ZNF275Q9NSD4 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ZNF275Q9NSD4 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ZNF275Q9NSD4 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ZNF275Q9NSD4 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ZNF275Q9NSD4 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ZNF275Q9NSD4 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ZNF275Q9NSD4 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ZNF275Q9NSD4 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ZNF275Q9NSD4 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ZNF275Q9NSD4 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ZNF275Q9NSD4 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ZNF275Q9NSD4 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ZNF275Q9NSD4 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ZNF275Q9NSD4 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ZNF275Q9NSD4 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ZNF275Q9NSD4 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
ZNF275Q9NSD4 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ZNF275Q9NSD4 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ZNF275Q9NSD4 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ZNF275Q9NSD4 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ZNF275Q9NSD4 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ZNF275Q9NSD4 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ZNF275Q9NSD4 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ZNF275Q9NSD4 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ZNF275Q9NSD4 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ZNF275Q9NSD4 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ZNF275Q9NSD4 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ZNF275Q9NSD4 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ZNF275Q9NSD4 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ZNF275Q9NSD4 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ZNF275Q9NSD4 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ZNF275Q9NSD4 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
ZNF275Q9NSD4 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ZNF275Q9NSD4 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ZNF275Q9NSD4 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ZNF275Q9NSD4 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ZNF275Q9NSD4 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ZNF275Q9NSD4 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ZNF275Q9NSD4 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
ZNF275Q9NSD4 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
ZNF275Q9NSD4 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ZNF275Q9NSD4 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ZNF275Q9NSD4 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ZNF275Q9NSD4 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.3 ms