Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSC2

SALL1, Sal-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,324 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SALL1Q9NSC2 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SALL1Q9NSC2 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SALL1Q9NSC2 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SALL1Q9NSC2 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SALL1Q9NSC2 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SALL1Q9NSC2 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SALL1Q9NSC2 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SALL1Q9NSC2 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SALL1Q9NSC2 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SALL1Q9NSC2 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SALL1Q9NSC2 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SALL1Q9NSC2 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SALL1Q9NSC2 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SALL1Q9NSC2 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SALL1Q9NSC2 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SALL1Q9NSC2 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SALL1Q9NSC2 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SALL1Q9NSC2 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SALL1Q9NSC2 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SALL1Q9NSC2 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SALL1Q9NSC2 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SALL1Q9NSC2 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SALL1Q9NSC2 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SALL1Q9NSC2 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SALL1Q9NSC2 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SALL1Q9NSC2 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SALL1Q9NSC2 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SALL1Q9NSC2 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SALL1Q9NSC2 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SALL1Q9NSC2 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SALL1Q9NSC2 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SALL1Q9NSC2 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SALL1Q9NSC2 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SALL1Q9NSC2 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SALL1Q9NSC2 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SALL1Q9NSC2 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SALL1Q9NSC2 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SALL1Q9NSC2 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SALL1Q9NSC2 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SALL1Q9NSC2 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SALL1Q9NSC2 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SALL1Q9NSC2 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SALL1Q9NSC2 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
SALL1Q9NSC2 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SALL1Q9NSC2 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SALL1Q9NSC2 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SALL1Q9NSC2 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SALL1Q9NSC2 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SALL1Q9NSC2 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SALL1Q9NSC2 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SALL1Q9NSC2 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SALL1Q9NSC2 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SALL1Q9NSC2 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SALL1Q9NSC2 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SALL1Q9NSC2 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SALL1Q9NSC2 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SALL1Q9NSC2 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SALL1Q9NSC2 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC24.39■■□□□ 1.5
SALL1Q9NSC2 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
SALL1Q9NSC2 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
SALL1Q9NSC2 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
SALL1Q9NSC2 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
SALL1Q9NSC2 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC24.39■■□□□ 1.5
SALL1Q9NSC2 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.5
SALL1Q9NSC2 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
SALL1Q9NSC2 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
SALL1Q9NSC2 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
SALL1Q9NSC2 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
SALL1Q9NSC2 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
SALL1Q9NSC2 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
SALL1Q9NSC2 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
SALL1Q9NSC2 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SALL1Q9NSC2 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SALL1Q9NSC2 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SALL1Q9NSC2 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SALL1Q9NSC2 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SALL1Q9NSC2 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SALL1Q9NSC2 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SALL1Q9NSC2 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
SALL1Q9NSC2 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SALL1Q9NSC2 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SALL1Q9NSC2 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SALL1Q9NSC2 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SALL1Q9NSC2 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SALL1Q9NSC2 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SALL1Q9NSC2 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SALL1Q9NSC2 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SALL1Q9NSC2 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
SALL1Q9NSC2 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SALL1Q9NSC2 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SALL1Q9NSC2 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SALL1Q9NSC2 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SALL1Q9NSC2 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
SALL1Q9NSC2 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SALL1Q9NSC2 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SALL1Q9NSC2 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SALL1Q9NSC2 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
SALL1Q9NSC2 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SALL1Q9NSC2 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SALL1Q9NSC2 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.2 ms