Protein–RNA interactions for Protein: Q9NS61

KCNIP2, Kv channel-interacting protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNIP2Q9NS61 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
KCNIP2Q9NS61 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
KCNIP2Q9NS61 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
KCNIP2Q9NS61 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
KCNIP2Q9NS61 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
KCNIP2Q9NS61 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC16■□□□□ 0.15
KCNIP2Q9NS61 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
KCNIP2Q9NS61 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
KCNIP2Q9NS61 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
KCNIP2Q9NS61 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC16■□□□□ 0.15
KCNIP2Q9NS61 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
KCNIP2Q9NS61 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
KCNIP2Q9NS61 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
KCNIP2Q9NS61 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC16■□□□□ 0.15
KCNIP2Q9NS61 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC16■□□□□ 0.15
KCNIP2Q9NS61 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
KCNIP2Q9NS61 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
KCNIP2Q9NS61 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
KCNIP2Q9NS61 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
KCNIP2Q9NS61 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
KCNIP2Q9NS61 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
KCNIP2Q9NS61 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
KCNIP2Q9NS61 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
KCNIP2Q9NS61 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
KCNIP2Q9NS61 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
KCNIP2Q9NS61 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
KCNIP2Q9NS61 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
KCNIP2Q9NS61 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
KCNIP2Q9NS61 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
KCNIP2Q9NS61 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
KCNIP2Q9NS61 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
KCNIP2Q9NS61 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
KCNIP2Q9NS61 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
KCNIP2Q9NS61 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
KCNIP2Q9NS61 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
KCNIP2Q9NS61 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
KCNIP2Q9NS61 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
KCNIP2Q9NS61 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
KCNIP2Q9NS61 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
KCNIP2Q9NS61 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
KCNIP2Q9NS61 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
KCNIP2Q9NS61 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
KCNIP2Q9NS61 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
KCNIP2Q9NS61 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
KCNIP2Q9NS61 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
KCNIP2Q9NS61 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
KCNIP2Q9NS61 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
KCNIP2Q9NS61 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
KCNIP2Q9NS61 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
KCNIP2Q9NS61 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
KCNIP2Q9NS61 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
KCNIP2Q9NS61 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
KCNIP2Q9NS61 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
KCNIP2Q9NS61 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
KCNIP2Q9NS61 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
KCNIP2Q9NS61 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
KCNIP2Q9NS61 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
KCNIP2Q9NS61 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
KCNIP2Q9NS61 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
KCNIP2Q9NS61 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
KCNIP2Q9NS61 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
KCNIP2Q9NS61 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
KCNIP2Q9NS61 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
KCNIP2Q9NS61 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
KCNIP2Q9NS61 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
KCNIP2Q9NS61 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
KCNIP2Q9NS61 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
KCNIP2Q9NS61 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
KCNIP2Q9NS61 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
KCNIP2Q9NS61 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
KCNIP2Q9NS61 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
KCNIP2Q9NS61 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
KCNIP2Q9NS61 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
KCNIP2Q9NS61 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
KCNIP2Q9NS61 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
KCNIP2Q9NS61 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
KCNIP2Q9NS61 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
KCNIP2Q9NS61 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
KCNIP2Q9NS61 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
KCNIP2Q9NS61 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
KCNIP2Q9NS61 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
KCNIP2Q9NS61 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
KCNIP2Q9NS61 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
KCNIP2Q9NS61 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
KCNIP2Q9NS61 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
KCNIP2Q9NS61 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
KCNIP2Q9NS61 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
KCNIP2Q9NS61 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
KCNIP2Q9NS61 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
KCNIP2Q9NS61 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
KCNIP2Q9NS61 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
KCNIP2Q9NS61 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
KCNIP2Q9NS61 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
KCNIP2Q9NS61 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
KCNIP2Q9NS61 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
KCNIP2Q9NS61 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
KCNIP2Q9NS61 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
KCNIP2Q9NS61 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
KCNIP2Q9NS61 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
KCNIP2Q9NS61 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.3 ms