Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQV6

PRDM10, PR domain zinc finger protein 10, humanhuman

Predictions only

Length 1,147 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRDM10Q9NQV6 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PRDM10Q9NQV6 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PRDM10Q9NQV6 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PRDM10Q9NQV6 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PRDM10Q9NQV6 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PRDM10Q9NQV6 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PRDM10Q9NQV6 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PRDM10Q9NQV6 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PRDM10Q9NQV6 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PRDM10Q9NQV6 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PRDM10Q9NQV6 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PRDM10Q9NQV6 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PRDM10Q9NQV6 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PRDM10Q9NQV6 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PRDM10Q9NQV6 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PRDM10Q9NQV6 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PRDM10Q9NQV6 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PRDM10Q9NQV6 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PRDM10Q9NQV6 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PRDM10Q9NQV6 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PRDM10Q9NQV6 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PRDM10Q9NQV6 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PRDM10Q9NQV6 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
PRDM10Q9NQV6 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PRDM10Q9NQV6 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PRDM10Q9NQV6 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PRDM10Q9NQV6 GPALPP1-207ENST00000611650 899 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
PRDM10Q9NQV6 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PRDM10Q9NQV6 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PRDM10Q9NQV6 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PRDM10Q9NQV6 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PRDM10Q9NQV6 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PRDM10Q9NQV6 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PRDM10Q9NQV6 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PRDM10Q9NQV6 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PRDM10Q9NQV6 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PRDM10Q9NQV6 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PRDM10Q9NQV6 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PRDM10Q9NQV6 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PRDM10Q9NQV6 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PRDM10Q9NQV6 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PRDM10Q9NQV6 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PRDM10Q9NQV6 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
PRDM10Q9NQV6 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PRDM10Q9NQV6 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PRDM10Q9NQV6 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PRDM10Q9NQV6 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PRDM10Q9NQV6 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PRDM10Q9NQV6 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PRDM10Q9NQV6 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PRDM10Q9NQV6 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PRDM10Q9NQV6 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PRDM10Q9NQV6 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PRDM10Q9NQV6 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PRDM10Q9NQV6 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PRDM10Q9NQV6 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PRDM10Q9NQV6 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PRDM10Q9NQV6 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PRDM10Q9NQV6 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PRDM10Q9NQV6 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PRDM10Q9NQV6 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PRDM10Q9NQV6 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PRDM10Q9NQV6 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PRDM10Q9NQV6 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PRDM10Q9NQV6 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PRDM10Q9NQV6 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PRDM10Q9NQV6 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PRDM10Q9NQV6 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PRDM10Q9NQV6 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PRDM10Q9NQV6 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PRDM10Q9NQV6 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PRDM10Q9NQV6 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PRDM10Q9NQV6 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PRDM10Q9NQV6 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PRDM10Q9NQV6 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PRDM10Q9NQV6 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
PRDM10Q9NQV6 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PRDM10Q9NQV6 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
PRDM10Q9NQV6 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PRDM10Q9NQV6 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
PRDM10Q9NQV6 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PRDM10Q9NQV6 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PRDM10Q9NQV6 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PRDM10Q9NQV6 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
PRDM10Q9NQV6 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PRDM10Q9NQV6 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PRDM10Q9NQV6 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PRDM10Q9NQV6 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PRDM10Q9NQV6 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PRDM10Q9NQV6 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
PRDM10Q9NQV6 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PRDM10Q9NQV6 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
PRDM10Q9NQV6 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
PRDM10Q9NQV6 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PRDM10Q9NQV6 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PRDM10Q9NQV6 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PRDM10Q9NQV6 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
PRDM10Q9NQV6 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PRDM10Q9NQV6 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
PRDM10Q9NQV6 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.2 ms