Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPB3

CABP2, Calcium-binding protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 220 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CABP2Q9NPB3 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
CABP2Q9NPB3 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC27.92■■■□□ 2.06
CABP2Q9NPB3 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
CABP2Q9NPB3 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
CABP2Q9NPB3 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
CABP2Q9NPB3 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
CABP2Q9NPB3 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
CABP2Q9NPB3 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC27.91■■■□□ 2.06
CABP2Q9NPB3 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
CABP2Q9NPB3 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
CABP2Q9NPB3 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
CABP2Q9NPB3 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
CABP2Q9NPB3 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
CABP2Q9NPB3 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
CABP2Q9NPB3 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
CABP2Q9NPB3 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
CABP2Q9NPB3 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC27.91■■■□□ 2.06
CABP2Q9NPB3 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
CABP2Q9NPB3 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
CABP2Q9NPB3 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
CABP2Q9NPB3 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
CABP2Q9NPB3 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
CABP2Q9NPB3 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
CABP2Q9NPB3 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
CABP2Q9NPB3 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
CABP2Q9NPB3 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
CABP2Q9NPB3 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
CABP2Q9NPB3 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC27.9■■■□□ 2.06
CABP2Q9NPB3 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
CABP2Q9NPB3 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
CABP2Q9NPB3 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.9■■■□□ 2.06
CABP2Q9NPB3 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
CABP2Q9NPB3 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
CABP2Q9NPB3 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
CABP2Q9NPB3 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
CABP2Q9NPB3 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
CABP2Q9NPB3 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
CABP2Q9NPB3 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
CABP2Q9NPB3 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
CABP2Q9NPB3 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
CABP2Q9NPB3 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
CABP2Q9NPB3 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
CABP2Q9NPB3 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
CABP2Q9NPB3 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.05
CABP2Q9NPB3 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
CABP2Q9NPB3 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC27.89■■■□□ 2.05
CABP2Q9NPB3 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
CABP2Q9NPB3 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
CABP2Q9NPB3 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
CABP2Q9NPB3 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
CABP2Q9NPB3 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
CABP2Q9NPB3 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
CABP2Q9NPB3 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
CABP2Q9NPB3 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
CABP2Q9NPB3 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
CABP2Q9NPB3 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
CABP2Q9NPB3 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
CABP2Q9NPB3 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
CABP2Q9NPB3 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
CABP2Q9NPB3 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
CABP2Q9NPB3 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
CABP2Q9NPB3 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
CABP2Q9NPB3 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC27.87■■■□□ 2.05
CABP2Q9NPB3 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
CABP2Q9NPB3 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
CABP2Q9NPB3 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
CABP2Q9NPB3 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
CABP2Q9NPB3 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
CABP2Q9NPB3 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
CABP2Q9NPB3 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC27.87■■■□□ 2.05
CABP2Q9NPB3 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
CABP2Q9NPB3 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
CABP2Q9NPB3 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
CABP2Q9NPB3 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
CABP2Q9NPB3 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
CABP2Q9NPB3 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
CABP2Q9NPB3 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
CABP2Q9NPB3 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
CABP2Q9NPB3 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
CABP2Q9NPB3 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
CABP2Q9NPB3 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC27.86■■■□□ 2.05
CABP2Q9NPB3 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
CABP2Q9NPB3 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
CABP2Q9NPB3 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
CABP2Q9NPB3 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
CABP2Q9NPB3 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
CABP2Q9NPB3 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
CABP2Q9NPB3 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
CABP2Q9NPB3 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
CABP2Q9NPB3 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
CABP2Q9NPB3 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
CABP2Q9NPB3 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
CABP2Q9NPB3 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
CABP2Q9NPB3 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC27.85■■■□□ 2.05
CABP2Q9NPB3 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
CABP2Q9NPB3 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
CABP2Q9NPB3 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
CABP2Q9NPB3 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
CABP2Q9NPB3 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
CABP2Q9NPB3 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.9 ms