Protein–RNA interactions for Protein: Q9H0K4

RSPH6A, Radial spoke head protein 6 homolog A, humanhuman

Predictions only

Length 717 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RSPH6AQ9H0K4 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
RSPH6AQ9H0K4 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
RSPH6AQ9H0K4 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
RSPH6AQ9H0K4 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
RSPH6AQ9H0K4 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
RSPH6AQ9H0K4 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
RSPH6AQ9H0K4 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
RSPH6AQ9H0K4 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
RSPH6AQ9H0K4 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
RSPH6AQ9H0K4 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC26.72■■□□□ 1.87
RSPH6AQ9H0K4 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC26.72■■□□□ 1.87
RSPH6AQ9H0K4 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
RSPH6AQ9H0K4 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
RSPH6AQ9H0K4 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
RSPH6AQ9H0K4 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
RSPH6AQ9H0K4 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
RSPH6AQ9H0K4 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
RSPH6AQ9H0K4 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
RSPH6AQ9H0K4 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
RSPH6AQ9H0K4 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
RSPH6AQ9H0K4 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
RSPH6AQ9H0K4 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
RSPH6AQ9H0K4 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
RSPH6AQ9H0K4 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
RSPH6AQ9H0K4 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
RSPH6AQ9H0K4 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
RSPH6AQ9H0K4 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
RSPH6AQ9H0K4 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC26.71■■□□□ 1.87
RSPH6AQ9H0K4 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC26.71■■□□□ 1.87
RSPH6AQ9H0K4 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
RSPH6AQ9H0K4 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
RSPH6AQ9H0K4 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
RSPH6AQ9H0K4 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
RSPH6AQ9H0K4 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
RSPH6AQ9H0K4 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
RSPH6AQ9H0K4 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
RSPH6AQ9H0K4 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
RSPH6AQ9H0K4 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
RSPH6AQ9H0K4 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
RSPH6AQ9H0K4 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
RSPH6AQ9H0K4 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
RSPH6AQ9H0K4 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
RSPH6AQ9H0K4 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
RSPH6AQ9H0K4 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
RSPH6AQ9H0K4 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
RSPH6AQ9H0K4 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
RSPH6AQ9H0K4 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC26.69■■□□□ 1.86
RSPH6AQ9H0K4 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
RSPH6AQ9H0K4 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.69■■□□□ 1.86
RSPH6AQ9H0K4 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC26.69■■□□□ 1.86
RSPH6AQ9H0K4 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
RSPH6AQ9H0K4 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
RSPH6AQ9H0K4 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
RSPH6AQ9H0K4 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
RSPH6AQ9H0K4 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
RSPH6AQ9H0K4 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
RSPH6AQ9H0K4 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
RSPH6AQ9H0K4 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
RSPH6AQ9H0K4 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC26.68■■□□□ 1.86
RSPH6AQ9H0K4 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
RSPH6AQ9H0K4 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
RSPH6AQ9H0K4 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
RSPH6AQ9H0K4 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
RSPH6AQ9H0K4 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
RSPH6AQ9H0K4 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
RSPH6AQ9H0K4 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
RSPH6AQ9H0K4 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
RSPH6AQ9H0K4 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
RSPH6AQ9H0K4 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
RSPH6AQ9H0K4 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
RSPH6AQ9H0K4 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
RSPH6AQ9H0K4 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
RSPH6AQ9H0K4 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
RSPH6AQ9H0K4 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
RSPH6AQ9H0K4 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
RSPH6AQ9H0K4 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
RSPH6AQ9H0K4 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
RSPH6AQ9H0K4 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.67■■□□□ 1.86
RSPH6AQ9H0K4 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
RSPH6AQ9H0K4 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
RSPH6AQ9H0K4 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
RSPH6AQ9H0K4 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
RSPH6AQ9H0K4 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
RSPH6AQ9H0K4 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
RSPH6AQ9H0K4 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
RSPH6AQ9H0K4 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
RSPH6AQ9H0K4 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
RSPH6AQ9H0K4 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
RSPH6AQ9H0K4 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
RSPH6AQ9H0K4 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
RSPH6AQ9H0K4 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
RSPH6AQ9H0K4 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
RSPH6AQ9H0K4 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
RSPH6AQ9H0K4 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC26.66■■□□□ 1.86
RSPH6AQ9H0K4 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
RSPH6AQ9H0K4 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
RSPH6AQ9H0K4 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
RSPH6AQ9H0K4 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
RSPH6AQ9H0K4 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
RSPH6AQ9H0K4 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.4 ms