Protein–RNA interactions for Protein: Q9H0F6

SHARPIN, Sharpin, humanhuman

Predictions only

Length 387 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHARPINQ9H0F6 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SHARPINQ9H0F6 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
SHARPINQ9H0F6 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SHARPINQ9H0F6 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SHARPINQ9H0F6 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SHARPINQ9H0F6 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SHARPINQ9H0F6 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SHARPINQ9H0F6 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SHARPINQ9H0F6 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SHARPINQ9H0F6 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SHARPINQ9H0F6 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SHARPINQ9H0F6 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SHARPINQ9H0F6 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SHARPINQ9H0F6 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SHARPINQ9H0F6 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
SHARPINQ9H0F6 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
SHARPINQ9H0F6 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SHARPINQ9H0F6 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SHARPINQ9H0F6 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SHARPINQ9H0F6 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SHARPINQ9H0F6 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SHARPINQ9H0F6 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SHARPINQ9H0F6 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SHARPINQ9H0F6 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SHARPINQ9H0F6 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SHARPINQ9H0F6 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SHARPINQ9H0F6 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
SHARPINQ9H0F6 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
SHARPINQ9H0F6 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
SHARPINQ9H0F6 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
SHARPINQ9H0F6 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
SHARPINQ9H0F6 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
SHARPINQ9H0F6 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
SHARPINQ9H0F6 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
SHARPINQ9H0F6 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
SHARPINQ9H0F6 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
SHARPINQ9H0F6 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
SHARPINQ9H0F6 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
SHARPINQ9H0F6 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
SHARPINQ9H0F6 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SHARPINQ9H0F6 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
SHARPINQ9H0F6 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SHARPINQ9H0F6 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
SHARPINQ9H0F6 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SHARPINQ9H0F6 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
SHARPINQ9H0F6 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
SHARPINQ9H0F6 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
SHARPINQ9H0F6 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SHARPINQ9H0F6 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SHARPINQ9H0F6 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SHARPINQ9H0F6 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
SHARPINQ9H0F6 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
SHARPINQ9H0F6 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
SHARPINQ9H0F6 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
SHARPINQ9H0F6 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
SHARPINQ9H0F6 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SHARPINQ9H0F6 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SHARPINQ9H0F6 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SHARPINQ9H0F6 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SHARPINQ9H0F6 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SHARPINQ9H0F6 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SHARPINQ9H0F6 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SHARPINQ9H0F6 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SHARPINQ9H0F6 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SHARPINQ9H0F6 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SHARPINQ9H0F6 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SHARPINQ9H0F6 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SHARPINQ9H0F6 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SHARPINQ9H0F6 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SHARPINQ9H0F6 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
SHARPINQ9H0F6 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SHARPINQ9H0F6 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
SHARPINQ9H0F6 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SHARPINQ9H0F6 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SHARPINQ9H0F6 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SHARPINQ9H0F6 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SHARPINQ9H0F6 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SHARPINQ9H0F6 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SHARPINQ9H0F6 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SHARPINQ9H0F6 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SHARPINQ9H0F6 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SHARPINQ9H0F6 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SHARPINQ9H0F6 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SHARPINQ9H0F6 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SHARPINQ9H0F6 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SHARPINQ9H0F6 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SHARPINQ9H0F6 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SHARPINQ9H0F6 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SHARPINQ9H0F6 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SHARPINQ9H0F6 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SHARPINQ9H0F6 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
SHARPINQ9H0F6 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SHARPINQ9H0F6 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SHARPINQ9H0F6 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SHARPINQ9H0F6 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SHARPINQ9H0F6 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SHARPINQ9H0F6 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SHARPINQ9H0F6 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SHARPINQ9H0F6 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SHARPINQ9H0F6 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.3 ms