Protein–RNA interactions for Protein: Q9H089

LSG1, Large subunit GTPase 1 homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 658 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LSG1Q9H089 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
LSG1Q9H089 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
LSG1Q9H089 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
LSG1Q9H089 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
LSG1Q9H089 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
LSG1Q9H089 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
LSG1Q9H089 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
LSG1Q9H089 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
LSG1Q9H089 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
LSG1Q9H089 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
LSG1Q9H089 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
LSG1Q9H089 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
LSG1Q9H089 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
LSG1Q9H089 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
LSG1Q9H089 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
LSG1Q9H089 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
LSG1Q9H089 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
LSG1Q9H089 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
LSG1Q9H089 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
LSG1Q9H089 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
LSG1Q9H089 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
LSG1Q9H089 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
LSG1Q9H089 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
LSG1Q9H089 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
LSG1Q9H089 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
LSG1Q9H089 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
LSG1Q9H089 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
LSG1Q9H089 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
LSG1Q9H089 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
LSG1Q9H089 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
LSG1Q9H089 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
LSG1Q9H089 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
LSG1Q9H089 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
LSG1Q9H089 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
LSG1Q9H089 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
LSG1Q9H089 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
LSG1Q9H089 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
LSG1Q9H089 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
LSG1Q9H089 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
LSG1Q9H089 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
LSG1Q9H089 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
LSG1Q9H089 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
LSG1Q9H089 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
LSG1Q9H089 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
LSG1Q9H089 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
LSG1Q9H089 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
LSG1Q9H089 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
LSG1Q9H089 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
LSG1Q9H089 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
LSG1Q9H089 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
LSG1Q9H089 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
LSG1Q9H089 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
LSG1Q9H089 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
LSG1Q9H089 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
LSG1Q9H089 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
LSG1Q9H089 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
LSG1Q9H089 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
LSG1Q9H089 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
LSG1Q9H089 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
LSG1Q9H089 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
LSG1Q9H089 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
LSG1Q9H089 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
LSG1Q9H089 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
LSG1Q9H089 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
LSG1Q9H089 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
LSG1Q9H089 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
LSG1Q9H089 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
LSG1Q9H089 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
LSG1Q9H089 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
LSG1Q9H089 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
LSG1Q9H089 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
LSG1Q9H089 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
LSG1Q9H089 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
LSG1Q9H089 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
LSG1Q9H089 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
LSG1Q9H089 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
LSG1Q9H089 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
LSG1Q9H089 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
LSG1Q9H089 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
LSG1Q9H089 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
LSG1Q9H089 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
LSG1Q9H089 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
LSG1Q9H089 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
LSG1Q9H089 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
LSG1Q9H089 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
LSG1Q9H089 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
LSG1Q9H089 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
LSG1Q9H089 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
LSG1Q9H089 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
LSG1Q9H089 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
LSG1Q9H089 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
LSG1Q9H089 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
LSG1Q9H089 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
LSG1Q9H089 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
LSG1Q9H089 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
LSG1Q9H089 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
LSG1Q9H089 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
LSG1Q9H089 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
LSG1Q9H089 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
LSG1Q9H089 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.4 ms