Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZT6

CCDC90B, Coiled-coil domain-containing protein 90B, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC90BQ9GZT6 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CCDC90BQ9GZT6 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
CCDC90BQ9GZT6 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
CCDC90BQ9GZT6 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
CCDC90BQ9GZT6 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
CCDC90BQ9GZT6 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
CCDC90BQ9GZT6 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CCDC90BQ9GZT6 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CCDC90BQ9GZT6 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CCDC90BQ9GZT6 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CCDC90BQ9GZT6 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CCDC90BQ9GZT6 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CCDC90BQ9GZT6 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CCDC90BQ9GZT6 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CCDC90BQ9GZT6 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CCDC90BQ9GZT6 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CCDC90BQ9GZT6 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CCDC90BQ9GZT6 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CCDC90BQ9GZT6 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CCDC90BQ9GZT6 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CCDC90BQ9GZT6 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CCDC90BQ9GZT6 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CCDC90BQ9GZT6 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CCDC90BQ9GZT6 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CCDC90BQ9GZT6 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CCDC90BQ9GZT6 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CCDC90BQ9GZT6 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CCDC90BQ9GZT6 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CCDC90BQ9GZT6 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CCDC90BQ9GZT6 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CCDC90BQ9GZT6 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
CCDC90BQ9GZT6 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CCDC90BQ9GZT6 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CCDC90BQ9GZT6 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CCDC90BQ9GZT6 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CCDC90BQ9GZT6 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CCDC90BQ9GZT6 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
CCDC90BQ9GZT6 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
CCDC90BQ9GZT6 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CCDC90BQ9GZT6 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CCDC90BQ9GZT6 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CCDC90BQ9GZT6 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CCDC90BQ9GZT6 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CCDC90BQ9GZT6 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CCDC90BQ9GZT6 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CCDC90BQ9GZT6 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CCDC90BQ9GZT6 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
CCDC90BQ9GZT6 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CCDC90BQ9GZT6 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CCDC90BQ9GZT6 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CCDC90BQ9GZT6 PKD1P1-201ENST00000458669 6805 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
CCDC90BQ9GZT6 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CCDC90BQ9GZT6 KDM6A-213ENST00000611820 5924 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CCDC90BQ9GZT6 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CCDC90BQ9GZT6 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CCDC90BQ9GZT6 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CCDC90BQ9GZT6 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CCDC90BQ9GZT6 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CCDC90BQ9GZT6 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CCDC90BQ9GZT6 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CCDC90BQ9GZT6 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CCDC90BQ9GZT6 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CCDC90BQ9GZT6 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CCDC90BQ9GZT6 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CCDC90BQ9GZT6 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CCDC90BQ9GZT6 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CCDC90BQ9GZT6 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CCDC90BQ9GZT6 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CCDC90BQ9GZT6 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CCDC90BQ9GZT6 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CCDC90BQ9GZT6 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CCDC90BQ9GZT6 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CCDC90BQ9GZT6 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CCDC90BQ9GZT6 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CCDC90BQ9GZT6 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CCDC90BQ9GZT6 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CCDC90BQ9GZT6 MAP4K4-205ENST00000350878 7640 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CCDC90BQ9GZT6 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CCDC90BQ9GZT6 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CCDC90BQ9GZT6 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CCDC90BQ9GZT6 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CCDC90BQ9GZT6 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CCDC90BQ9GZT6 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CCDC90BQ9GZT6 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CCDC90BQ9GZT6 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CCDC90BQ9GZT6 ARHGEF28-212ENST00000513042 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CCDC90BQ9GZT6 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CCDC90BQ9GZT6 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CCDC90BQ9GZT6 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CCDC90BQ9GZT6 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CCDC90BQ9GZT6 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CCDC90BQ9GZT6 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CCDC90BQ9GZT6 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CCDC90BQ9GZT6 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CCDC90BQ9GZT6 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CCDC90BQ9GZT6 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CCDC90BQ9GZT6 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CCDC90BQ9GZT6 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CCDC90BQ9GZT6 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CCDC90BQ9GZT6 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.1 ms