Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZS1

POLR1E, DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA49, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR1EQ9GZS1 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
POLR1EQ9GZS1 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
POLR1EQ9GZS1 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
POLR1EQ9GZS1 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
POLR1EQ9GZS1 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
POLR1EQ9GZS1 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
POLR1EQ9GZS1 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
POLR1EQ9GZS1 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
POLR1EQ9GZS1 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
POLR1EQ9GZS1 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
POLR1EQ9GZS1 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
POLR1EQ9GZS1 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
POLR1EQ9GZS1 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
POLR1EQ9GZS1 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
POLR1EQ9GZS1 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
POLR1EQ9GZS1 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
POLR1EQ9GZS1 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
POLR1EQ9GZS1 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
POLR1EQ9GZS1 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
POLR1EQ9GZS1 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
POLR1EQ9GZS1 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
POLR1EQ9GZS1 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
POLR1EQ9GZS1 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
POLR1EQ9GZS1 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
POLR1EQ9GZS1 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
POLR1EQ9GZS1 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
POLR1EQ9GZS1 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
POLR1EQ9GZS1 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
POLR1EQ9GZS1 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
POLR1EQ9GZS1 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
POLR1EQ9GZS1 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
POLR1EQ9GZS1 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
POLR1EQ9GZS1 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
POLR1EQ9GZS1 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
POLR1EQ9GZS1 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
POLR1EQ9GZS1 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
POLR1EQ9GZS1 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
POLR1EQ9GZS1 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
POLR1EQ9GZS1 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
POLR1EQ9GZS1 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
POLR1EQ9GZS1 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
POLR1EQ9GZS1 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
POLR1EQ9GZS1 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
POLR1EQ9GZS1 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
POLR1EQ9GZS1 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
POLR1EQ9GZS1 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
POLR1EQ9GZS1 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
POLR1EQ9GZS1 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
POLR1EQ9GZS1 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC20.44■□□□□ 0.86
POLR1EQ9GZS1 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
POLR1EQ9GZS1 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
POLR1EQ9GZS1 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
POLR1EQ9GZS1 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
POLR1EQ9GZS1 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
POLR1EQ9GZS1 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
POLR1EQ9GZS1 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
POLR1EQ9GZS1 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
POLR1EQ9GZS1 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
POLR1EQ9GZS1 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
POLR1EQ9GZS1 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
POLR1EQ9GZS1 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
POLR1EQ9GZS1 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
POLR1EQ9GZS1 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
POLR1EQ9GZS1 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
POLR1EQ9GZS1 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
POLR1EQ9GZS1 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
POLR1EQ9GZS1 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
POLR1EQ9GZS1 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
POLR1EQ9GZS1 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
POLR1EQ9GZS1 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
POLR1EQ9GZS1 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
POLR1EQ9GZS1 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
POLR1EQ9GZS1 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
POLR1EQ9GZS1 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
POLR1EQ9GZS1 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
POLR1EQ9GZS1 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
POLR1EQ9GZS1 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
POLR1EQ9GZS1 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
POLR1EQ9GZS1 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
POLR1EQ9GZS1 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
POLR1EQ9GZS1 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
POLR1EQ9GZS1 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
POLR1EQ9GZS1 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
POLR1EQ9GZS1 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
POLR1EQ9GZS1 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
POLR1EQ9GZS1 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
POLR1EQ9GZS1 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
POLR1EQ9GZS1 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
POLR1EQ9GZS1 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC20.42■□□□□ 0.86
POLR1EQ9GZS1 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
POLR1EQ9GZS1 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
POLR1EQ9GZS1 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
POLR1EQ9GZS1 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
POLR1EQ9GZS1 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
POLR1EQ9GZS1 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
POLR1EQ9GZS1 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
POLR1EQ9GZS1 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
POLR1EQ9GZS1 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
POLR1EQ9GZS1 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
POLR1EQ9GZS1 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.4 ms