Protein–RNA interactions for Protein: Q9C002

NMES1, Normal mucosa of esophagus-specific gene 1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 83 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NMES1Q9C002 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
NMES1Q9C002 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
NMES1Q9C002 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
NMES1Q9C002 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
NMES1Q9C002 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
NMES1Q9C002 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
NMES1Q9C002 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
NMES1Q9C002 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
NMES1Q9C002 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
NMES1Q9C002 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
NMES1Q9C002 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
NMES1Q9C002 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
NMES1Q9C002 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
NMES1Q9C002 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
NMES1Q9C002 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
NMES1Q9C002 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
NMES1Q9C002 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
NMES1Q9C002 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
NMES1Q9C002 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
NMES1Q9C002 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
NMES1Q9C002 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
NMES1Q9C002 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NMES1Q9C002 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
NMES1Q9C002 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NMES1Q9C002 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NMES1Q9C002 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
NMES1Q9C002 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NMES1Q9C002 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
NMES1Q9C002 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
NMES1Q9C002 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
NMES1Q9C002 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NMES1Q9C002 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
NMES1Q9C002 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
NMES1Q9C002 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
NMES1Q9C002 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NMES1Q9C002 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NMES1Q9C002 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
NMES1Q9C002 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
NMES1Q9C002 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
NMES1Q9C002 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NMES1Q9C002 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NMES1Q9C002 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NMES1Q9C002 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NMES1Q9C002 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
NMES1Q9C002 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
NMES1Q9C002 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
NMES1Q9C002 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NMES1Q9C002 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NMES1Q9C002 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NMES1Q9C002 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
NMES1Q9C002 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NMES1Q9C002 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NMES1Q9C002 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NMES1Q9C002 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
NMES1Q9C002 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NMES1Q9C002 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NMES1Q9C002 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
NMES1Q9C002 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NMES1Q9C002 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
NMES1Q9C002 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NMES1Q9C002 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
NMES1Q9C002 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NMES1Q9C002 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
NMES1Q9C002 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NMES1Q9C002 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
NMES1Q9C002 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
NMES1Q9C002 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
NMES1Q9C002 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NMES1Q9C002 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
NMES1Q9C002 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
NMES1Q9C002 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
NMES1Q9C002 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
NMES1Q9C002 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NMES1Q9C002 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
NMES1Q9C002 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
NMES1Q9C002 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
NMES1Q9C002 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
NMES1Q9C002 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
NMES1Q9C002 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
NMES1Q9C002 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NMES1Q9C002 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NMES1Q9C002 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NMES1Q9C002 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NMES1Q9C002 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
NMES1Q9C002 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NMES1Q9C002 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
NMES1Q9C002 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NMES1Q9C002 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NMES1Q9C002 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NMES1Q9C002 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
NMES1Q9C002 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
NMES1Q9C002 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NMES1Q9C002 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
NMES1Q9C002 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
NMES1Q9C002 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
NMES1Q9C002 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NMES1Q9C002 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
NMES1Q9C002 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NMES1Q9C002 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
NMES1Q9C002 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.6 ms