Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYS1

KRTAP1-5, Keratin-associated protein 1-5, humanhuman

Predictions only

Length 174 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP1-5Q9BYS1 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
KRTAP1-5Q9BYS1 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
KRTAP1-5Q9BYS1 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
KRTAP1-5Q9BYS1 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
KRTAP1-5Q9BYS1 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
KRTAP1-5Q9BYS1 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
KRTAP1-5Q9BYS1 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
KRTAP1-5Q9BYS1 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
KRTAP1-5Q9BYS1 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
KRTAP1-5Q9BYS1 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
KRTAP1-5Q9BYS1 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
KRTAP1-5Q9BYS1 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
KRTAP1-5Q9BYS1 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
KRTAP1-5Q9BYS1 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
KRTAP1-5Q9BYS1 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
KRTAP1-5Q9BYS1 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
KRTAP1-5Q9BYS1 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
KRTAP1-5Q9BYS1 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
KRTAP1-5Q9BYS1 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
KRTAP1-5Q9BYS1 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
KRTAP1-5Q9BYS1 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
KRTAP1-5Q9BYS1 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
KRTAP1-5Q9BYS1 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC13.55□□□□□ -0.24
KRTAP1-5Q9BYS1 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC13.55□□□□□ -0.24
KRTAP1-5Q9BYS1 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
KRTAP1-5Q9BYS1 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
KRTAP1-5Q9BYS1 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
KRTAP1-5Q9BYS1 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
KRTAP1-5Q9BYS1 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
KRTAP1-5Q9BYS1 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
KRTAP1-5Q9BYS1 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
KRTAP1-5Q9BYS1 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
KRTAP1-5Q9BYS1 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
KRTAP1-5Q9BYS1 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
KRTAP1-5Q9BYS1 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
KRTAP1-5Q9BYS1 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
KRTAP1-5Q9BYS1 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
KRTAP1-5Q9BYS1 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
KRTAP1-5Q9BYS1 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
KRTAP1-5Q9BYS1 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
KRTAP1-5Q9BYS1 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
KRTAP1-5Q9BYS1 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
KRTAP1-5Q9BYS1 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
KRTAP1-5Q9BYS1 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
KRTAP1-5Q9BYS1 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
KRTAP1-5Q9BYS1 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
KRTAP1-5Q9BYS1 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
KRTAP1-5Q9BYS1 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
KRTAP1-5Q9BYS1 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
KRTAP1-5Q9BYS1 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
KRTAP1-5Q9BYS1 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
KRTAP1-5Q9BYS1 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
KRTAP1-5Q9BYS1 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
KRTAP1-5Q9BYS1 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
KRTAP1-5Q9BYS1 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
KRTAP1-5Q9BYS1 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
KRTAP1-5Q9BYS1 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
KRTAP1-5Q9BYS1 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
KRTAP1-5Q9BYS1 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
KRTAP1-5Q9BYS1 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
KRTAP1-5Q9BYS1 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
KRTAP1-5Q9BYS1 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
KRTAP1-5Q9BYS1 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
KRTAP1-5Q9BYS1 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
KRTAP1-5Q9BYS1 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
KRTAP1-5Q9BYS1 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
KRTAP1-5Q9BYS1 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
KRTAP1-5Q9BYS1 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
KRTAP1-5Q9BYS1 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
KRTAP1-5Q9BYS1 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
KRTAP1-5Q9BYS1 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
KRTAP1-5Q9BYS1 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
KRTAP1-5Q9BYS1 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
KRTAP1-5Q9BYS1 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
KRTAP1-5Q9BYS1 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
KRTAP1-5Q9BYS1 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
KRTAP1-5Q9BYS1 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC13.53□□□□□ -0.24
KRTAP1-5Q9BYS1 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
KRTAP1-5Q9BYS1 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
KRTAP1-5Q9BYS1 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
KRTAP1-5Q9BYS1 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
KRTAP1-5Q9BYS1 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
KRTAP1-5Q9BYS1 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
KRTAP1-5Q9BYS1 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
KRTAP1-5Q9BYS1 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
KRTAP1-5Q9BYS1 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
KRTAP1-5Q9BYS1 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
KRTAP1-5Q9BYS1 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
KRTAP1-5Q9BYS1 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
KRTAP1-5Q9BYS1 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
KRTAP1-5Q9BYS1 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC13.52□□□□□ -0.24
KRTAP1-5Q9BYS1 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
KRTAP1-5Q9BYS1 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.24
KRTAP1-5Q9BYS1 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.24
KRTAP1-5Q9BYS1 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
KRTAP1-5Q9BYS1 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
KRTAP1-5Q9BYS1 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
KRTAP1-5Q9BYS1 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
KRTAP1-5Q9BYS1 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
KRTAP1-5Q9BYS1 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.2 ms