Protein–RNA interactions for Protein: Q9BX63

BRIP1, Fanconi anemia group J protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRIP1Q9BX63 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
BRIP1Q9BX63 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
BRIP1Q9BX63 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
BRIP1Q9BX63 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
BRIP1Q9BX63 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
BRIP1Q9BX63 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
BRIP1Q9BX63 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
BRIP1Q9BX63 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
BRIP1Q9BX63 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
BRIP1Q9BX63 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
BRIP1Q9BX63 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
BRIP1Q9BX63 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC25.14■■□□□ 1.62
BRIP1Q9BX63 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
BRIP1Q9BX63 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
BRIP1Q9BX63 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
BRIP1Q9BX63 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
BRIP1Q9BX63 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
BRIP1Q9BX63 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
BRIP1Q9BX63 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
BRIP1Q9BX63 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
BRIP1Q9BX63 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
BRIP1Q9BX63 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
BRIP1Q9BX63 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
BRIP1Q9BX63 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
BRIP1Q9BX63 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
BRIP1Q9BX63 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
BRIP1Q9BX63 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
BRIP1Q9BX63 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
BRIP1Q9BX63 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
BRIP1Q9BX63 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
BRIP1Q9BX63 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
BRIP1Q9BX63 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC25.13■■□□□ 1.61
BRIP1Q9BX63 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
BRIP1Q9BX63 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
BRIP1Q9BX63 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
BRIP1Q9BX63 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
BRIP1Q9BX63 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
BRIP1Q9BX63 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
BRIP1Q9BX63 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC25.12■■□□□ 1.61
BRIP1Q9BX63 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
BRIP1Q9BX63 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
BRIP1Q9BX63 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
BRIP1Q9BX63 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
BRIP1Q9BX63 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
BRIP1Q9BX63 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
BRIP1Q9BX63 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
BRIP1Q9BX63 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
BRIP1Q9BX63 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
BRIP1Q9BX63 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
BRIP1Q9BX63 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
BRIP1Q9BX63 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
BRIP1Q9BX63 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
BRIP1Q9BX63 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
BRIP1Q9BX63 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
BRIP1Q9BX63 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
BRIP1Q9BX63 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC25.11■■□□□ 1.61
BRIP1Q9BX63 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
BRIP1Q9BX63 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
BRIP1Q9BX63 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
BRIP1Q9BX63 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
BRIP1Q9BX63 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
BRIP1Q9BX63 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
BRIP1Q9BX63 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
BRIP1Q9BX63 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
BRIP1Q9BX63 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
BRIP1Q9BX63 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
BRIP1Q9BX63 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
BRIP1Q9BX63 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
BRIP1Q9BX63 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
BRIP1Q9BX63 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
BRIP1Q9BX63 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
BRIP1Q9BX63 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
BRIP1Q9BX63 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
BRIP1Q9BX63 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
BRIP1Q9BX63 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
BRIP1Q9BX63 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
BRIP1Q9BX63 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
BRIP1Q9BX63 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
BRIP1Q9BX63 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
BRIP1Q9BX63 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
BRIP1Q9BX63 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
BRIP1Q9BX63 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
BRIP1Q9BX63 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
BRIP1Q9BX63 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
BRIP1Q9BX63 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
BRIP1Q9BX63 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
BRIP1Q9BX63 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
BRIP1Q9BX63 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
BRIP1Q9BX63 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
BRIP1Q9BX63 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
BRIP1Q9BX63 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
BRIP1Q9BX63 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
BRIP1Q9BX63 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
BRIP1Q9BX63 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
BRIP1Q9BX63 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
BRIP1Q9BX63 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
BRIP1Q9BX63 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
BRIP1Q9BX63 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
BRIP1Q9BX63 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
BRIP1Q9BX63 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24 ms